A Comprehensive Web-based Platform For Domain-Specific Biological Models

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67179843%3A_____%2F13%3A00426649" target="_blank" >RIV/67179843:_____/13:00426649 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2013.11.006" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2013.11.006</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.entcs.2013.11.006" target="_blank" >10.1016/j.entcs.2013.11.006</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

A Comprehensive Web-based Platform For Domain-Specific Biological Models

Popis výsledku v původním jazyce

A Comprehensive Modeling Platform, that is, a general framework for public sharing, annotation, and visualization of domain-specific biological models, is presented. For a selected organism, the framework is instantiated as a web-based application whichallows to capture several aspects of biological models represented as biochemical reaction networks or ordinary differential equations. The key feature of the instantiation for a given organism relies on mapping kinetic models to a precise textual and aschematic graphical representation of the related biological knowledge, thereby supporting the systems biological view of the modeled organism. Besides model repository and annotation, the platform includes basic model analysis features such as simulation and static analysis.

Název v anglickém jazyce

A Comprehensive Web-based Platform For Domain-Specific Biological Models

Popis výsledku anglicky

A Comprehensive Modeling Platform, that is, a general framework for public sharing, annotation, and visualization of domain-specific biological models, is presented. For a selected organism, the framework is instantiated as a web-based application whichallows to capture several aspects of biological models represented as biochemical reaction networks or ordinary differential equations. The key feature of the instantiation for a given organism relies on mapping kinetic models to a precise textual and aschematic graphical representation of the related biological knowledge, thereby supporting the systems biological view of the modeled organism. Besides model repository and annotation, the platform includes basic model analysis features such as simulation and static analysis.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EH - Ekologie – společenstva

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/EE2.3.20.0256" target="_blank" >EE2.3.20.0256: Vytvoření výzkumného týmu a mezinárodního konzorcia pro počítačový model buňky sinice</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Electronic Notes in Theoretical Computer Science

ISSN

1571-0661

e-ISSN

—

Svazek periodika

299

Číslo periodika v rámci svazku

25 Dec

Stát vydavatele periodika

NL - Nizozemsko

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

61-67

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—