SpinDoctor: A MATLAB toolbox for diffusion MRI simulation

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985556%3A_____%2F19%3A00509266" target="_blank" >RIV/67985556:_____/19:00509266 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/60076658:12310/19:43899347

Výsledek na webu

<a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1053811919307116" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1053811919307116</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.neuroimage.2019.116120" target="_blank" >10.1016/j.neuroimage.2019.116120</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

SpinDoctor: A MATLAB toolbox for diffusion MRI simulation

Popis výsledku v původním jazyce

This paper describes a publicly available MATLAB toolbox called SpinDoctor that can be used 1) to solve the Bloch-Torrey partial differential equation in order to simulate the diffusion magnetic resonance imaging signal. 2) to solve a diffusion partial differential equation to obtain directly the apparent diffusion coefficient. 3) to compare the simulated apparent diffusion coefficient with a short-time approximation formula. The partial differential equations are solved by P1 finite elements combined with built-in MATLAB routines for solving ordinary differential equations. The finite element mesh generation is performed using an external package called Tetgen.

Název v anglickém jazyce

SpinDoctor: A MATLAB toolbox for diffusion MRI simulation

Popis výsledku anglicky

This paper describes a publicly available MATLAB toolbox called SpinDoctor that can be used 1) to solve the Bloch-Torrey partial differential equation in order to simulate the diffusion magnetic resonance imaging signal. 2) to solve a diffusion partial differential equation to obtain directly the apparent diffusion coefficient. 3) to compare the simulated apparent diffusion coefficient with a short-time approximation formula. The partial differential equations are solved by P1 finite elements combined with built-in MATLAB routines for solving ordinary differential equations. The finite element mesh generation is performed using an external package called Tetgen.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10101 - Pure mathematics

Projekt

<a href="/cs/project/GA17-04301S" target="_blank" >GA17-04301S: Pokročilé matematické metody pro disipativní evoluční systémy</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Neuroimage

ISSN

1053-8119

e-ISSN

—

Svazek periodika

202

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

23

Strana od-do

116120

Kód UT WoS článku

000491861000094

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85071780835