Tensor methods for parameter estimation and bifurcation analysis of stochastic reaction networks

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985840%3A_____%2F15%3A00444817" target="_blank" >RIV/67985840:_____/15:00444817 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1098/rsif.2015.0233" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1098/rsif.2015.0233</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1098/rsif.2015.0233" target="_blank" >10.1098/rsif.2015.0233</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Tensor methods for parameter estimation and bifurcation analysis of stochastic reaction networks

Popis výsledku v původním jazyce

In this paper, tensor-structured parametric analysis (TPA) is developed to address these computational challenges. It is based on recently proposed low-parametric tensor-structured representations of classical matrices and vectors. This approach enablessimultaneous computation of the model properties for all parameter values within a parameter space. The TPA is illustrated by studying the parameter estimation, robustness, sensitivity and bifurcation structure in stochastic models of biochemical networks. A Matlab implementation of the TPA is available at http://www.stobifan.org.

Název v anglickém jazyce

Tensor methods for parameter estimation and bifurcation analysis of stochastic reaction networks

Popis výsledku anglicky

In this paper, tensor-structured parametric analysis (TPA) is developed to address these computational challenges. It is based on recently proposed low-parametric tensor-structured representations of classical matrices and vectors. This approach enablessimultaneous computation of the model properties for all parameter values within a parameter space. The TPA is illustrated by studying the parameter estimation, robustness, sensitivity and bifurcation structure in stochastic models of biochemical networks. A Matlab implementation of the TPA is available at http://www.stobifan.org.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BA - Obecná matematika

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of the Royal Society Interface

ISSN

1742-5689

e-ISSN

—

Svazek periodika

12

Číslo periodika v rámci svazku

108

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000358824600018

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-84936742767