Molecular dynamics simulation dataset of a kinesin on tubulin heterodimers in electric field

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985882%3A_____%2F24%3A00572572" target="_blank" >RIV/67985882:_____/24:00572572 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340923008326?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352340923008326?via%3Dihub</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Molecular dynamics simulation dataset of a kinesin on tubulin heterodimers in electric field

Popis výsledku v původním jazyce

We present trajectories from non-equilibrium (in electric field) molecular dynamics (MD) simulations of a kinesin motor domain on tubulin heterodimers with two tubulin heterodimers forming neighbouring microtubule protofilaments. The trajectories are for no field (long equilibrium simulation), for four different electric field orientations (X, -X, Y, -Y) and for the X electric field at four different field strengths. We also provide a trajectory for larger simulation box. Our data enable to analyze the electric field effects on kinesin, which ultimately leads to kinesin detachment. This data set was used to understand the effect of electric field orientation and field strength on the kinetics and energetics of the electro-detachment of kinesin

Název v anglickém jazyce

Molecular dynamics simulation dataset of a kinesin on tubulin heterodimers in electric field

Popis výsledku anglicky

We present trajectories from non-equilibrium (in electric field) molecular dynamics (MD) simulations of a kinesin motor domain on tubulin heterodimers with two tubulin heterodimers forming neighbouring microtubule protofilaments. The trajectories are for no field (long equilibrium simulation), for four different electric field orientations (X, -X, Y, -Y) and for the X electric field at four different field strengths. We also provide a trajectory for larger simulation box. Our data enable to analyze the electric field effects on kinesin, which ultimately leads to kinesin detachment. This data set was used to understand the effect of electric field orientation and field strength on the kinetics and energetics of the electro-detachment of kinesin

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10610 - Biophysics

Projekt

<a href="/cs/project/GX20-06873X" target="_blank" >GX20-06873X: SubTHz chipová zařízení pro řízení proteinových nanopřístrojů</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů