Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Diversity of Anaerobic Fungi within Cow Manure Determined by ITS1 Analysis

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985904%3A_____%2F10%3A00347929" target="_blank" >RIV/67985904:_____/10:00347929 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/60461373:22320/10:00023861

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Diversity of Anaerobic Fungi within Cow Manure Determined by ITS1 Analysis

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The diversity of anaerobic fungi was evaluated in cow semiliquid manure obtained from input homogenizing tank of biogas plant. Among three sets of tested primers, the combination of fungal universal ITS1F and Neocallimastigales specific Neo QPCR Rev primers was selected and used for the construction of clone library. Eighty-four new complete internal transcribed spacers (ITS1) and partial 5.8S rDNA sequences generated within this study were analyzed by Bayesian inference and assigned to an existing order of the Neocallimastigales. Sixty-seven % of sequences were affiliated with Cyllamyces, 24 % with Piromyces, 7 % with Anaeromyces, only 2 % with Neocallimastix, and no sequences with Orpinomyces. According to Bayesian analysis the genus Caecomyces was polyphyletic and disappeared from the presented ITS-based phylogram. This study gave a first insight into the diversity of anaerobic fungi in cow manure, where the prevalence of fungi with bulbous morphology was indicated.

  • Název v anglickém jazyce

    Diversity of Anaerobic Fungi within Cow Manure Determined by ITS1 Analysis

  • Popis výsledku anglicky

    The diversity of anaerobic fungi was evaluated in cow semiliquid manure obtained from input homogenizing tank of biogas plant. Among three sets of tested primers, the combination of fungal universal ITS1F and Neocallimastigales specific Neo QPCR Rev primers was selected and used for the construction of clone library. Eighty-four new complete internal transcribed spacers (ITS1) and partial 5.8S rDNA sequences generated within this study were analyzed by Bayesian inference and assigned to an existing order of the Neocallimastigales. Sixty-seven % of sequences were affiliated with Cyllamyces, 24 % with Piromyces, 7 % with Anaeromyces, only 2 % with Neocallimastix, and no sequences with Orpinomyces. According to Bayesian analysis the genus Caecomyces was polyphyletic and disappeared from the presented ITS-based phylogram. This study gave a first insight into the diversity of anaerobic fungi in cow manure, where the prevalence of fungi with bulbous morphology was indicated.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EH - Ekologie – společenstva

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2010

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Folia Microbiologica

  • ISSN

    0015-5632

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    55

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    CZ - Česká republika

  • Počet stran výsledku

    6

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000281277900004

  • EID výsledku v databázi Scopus