The complete mitochondrial transcript of the red tail loach Yasuhikotakia modesta as assembled from RNAseq (Teleostei: Botiidae)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985904%3A_____%2F17%3A00475266" target="_blank" >RIV/67985904:_____/17:00475266 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1080/23802359.2016.1275851" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1080/23802359.2016.1275851</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1080/23802359.2016.1275851" target="_blank" >10.1080/23802359.2016.1275851</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

The complete mitochondrial transcript of the red tail loach Yasuhikotakia modesta as assembled from RNAseq (Teleostei: Botiidae)

Popis výsledku v původním jazyce

Here, we present the first complete mitochondrial genome of the Red Tailed Loach Yasuhikotakia modesta (Teleostei: Botiidae) from Thailand, assembled from next-generation transcriptome sequencing data. The assembled transcript corresponds to the full length mitochondrial genome of Y. modesta, which measured 16,865 bp in length, and contained 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA genes, and 22 transfer RNA genes. A slight A+T bias was observed in the mitogenome of Y. modesta with an overall base composition of 32.2% A, 25.8% T, 26.4% C, and 15.4% G, and a GC content of 41.8%. The gene arrangement was identical to that of previously described loach mitogenomes.

Název v anglickém jazyce

The complete mitochondrial transcript of the red tail loach Yasuhikotakia modesta as assembled from RNAseq (Teleostei: Botiidae)

Popis výsledku anglicky

Here, we present the first complete mitochondrial genome of the Red Tailed Loach Yasuhikotakia modesta (Teleostei: Botiidae) from Thailand, assembled from next-generation transcriptome sequencing data. The assembled transcript corresponds to the full length mitochondrial genome of Y. modesta, which measured 16,865 bp in length, and contained 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA genes, and 22 transfer RNA genes. A slight A+T bias was observed in the mitogenome of Y. modesta with an overall base composition of 32.2% A, 25.8% T, 26.4% C, and 15.4% G, and a GC content of 41.8%. The gene arrangement was identical to that of previously described loach mitogenomes.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

Projekt

<a href="/cs/project/GA13-37277S" target="_blank" >GA13-37277S: Mechanismy a role polyploidizace v evoluci živočichů – příklad ryb čeledi Botiidae</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Mitochondrial DNA part B

ISSN

2380-2359

e-ISSN

—

Svazek periodika

2

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

46-47

Kód UT WoS článku

000402042700022

EID výsledku v databázi Scopus

—