Isolating Chromosomes of the Komodo Dragon: New Tools for Comparative Mapping and Sequence Assembly
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985904%3A_____%2F19%3A00511982" target="_blank" >RIV/67985904:_____/19:00511982 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216208:11310/19:10406965
Výsledek na webu
<a href="https://asep.lib.cas.cz/arl-cav/cs/csg/?repo=crepo1&key=41048410983" target="_blank" >https://asep.lib.cas.cz/arl-cav/cs/csg/?repo=crepo1&key=41048410983</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1159/000496171" target="_blank" >10.1159/000496171</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Isolating Chromosomes of the Komodo Dragon: New Tools for Comparative Mapping and Sequence Assembly
Popis výsledku v původním jazyce
We developed new tools to build a high-quality chromosomal map of the Komodo dragon (Varanus komodoensis) available for cross-species phylogenomic analyses. First, we isolated chromosomes by flow sorting and determined the chromosome content of each flow karyotype peak by FISH. We then isolated additional Komodo dragon chromosomes by microdissection and amplified chromosome-specific DNA pools. The chromosome-specific DNA pools can be sequenced, assembled, and mapped by next-generation sequencing technology. The chromosome-specific paint probes can be used to investigate karyotype evolution through cross-species chromosome painting. Overall, the set of chromosome-specific DNA pools of V. komodoensis provides new tools for detailed phylogenomic analyses of Varanidae and squamates in general.
Název v anglickém jazyce
Isolating Chromosomes of the Komodo Dragon: New Tools for Comparative Mapping and Sequence Assembly
Popis výsledku anglicky
We developed new tools to build a high-quality chromosomal map of the Komodo dragon (Varanus komodoensis) available for cross-species phylogenomic analyses. First, we isolated chromosomes by flow sorting and determined the chromosome content of each flow karyotype peak by FISH. We then isolated additional Komodo dragon chromosomes by microdissection and amplified chromosome-specific DNA pools. The chromosome-specific DNA pools can be sequenced, assembled, and mapped by next-generation sequencing technology. The chromosome-specific paint probes can be used to investigate karyotype evolution through cross-species chromosome painting. Overall, the set of chromosome-specific DNA pools of V. komodoensis provides new tools for detailed phylogenomic analyses of Varanidae and squamates in general.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10613 - Zoology
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GJ17-22141Y" target="_blank" >GJ17-22141Y: Evoluce pohlavních chromozomů plazů skupiny Toxicofera</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Cytogenetic and Genome Research
ISSN
1424-8581
e-ISSN
—
Svazek periodika
157
Číslo periodika v rámci svazku
1-2
Stát vydavatele periodika
CH - Švýcarská konfederace
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
123-131
Kód UT WoS článku
000466128800013
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85060205083