Beyond the Net: Optimizing eDNA Sampling and Analysis for Challenging Muddy Habitats and the Endangered Weatherfish (Misgurnus fossilis)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985904%3A_____%2F25%3A00645424" target="_blank" >RIV/67985904:_____/25:00645424 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://aca.pensoft.net/article/180307/" target="_blank" >https://aca.pensoft.net/article/180307/</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.3897/aca.8.e180307" target="_blank" >10.3897/aca.8.e180307</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Beyond the Net: Optimizing eDNA Sampling and Analysis for Challenging Muddy Habitats and the Endangered Weatherfish (Misgurnus fossilis)

Popis výsledku v původním jazyce

Elusive and endangered species are prime candidates for environmental DNA (eDNA) monitoring (Duarte et al. 2023). The European weatherfish (Misgurnus fossilis) is one such species where traditional fishing methods may not yield conclusive results on its presence/absence. On the other hand, eDNA monitoring is less labour-intensive than conventional methods and may require only a small amount of water if species-specific qPCR/ddPCR markers are utilised (Thomsen et al. 2011, Sigsgaard et al. 2015, Kusanke et al. 2020, Brys et al. 2020). We aim to develop a standardised eDNA protocol that would provide additional information to traditional fishing surveys of Misgurnus . Such surveys are especially challenging in smaller vegetated waterbodies and wetlands in Central Europe where electrofishing, dip-netting, or fish trapping may not be feasible. As such, these wetland habitats are also among the most neglected European habitats despite facing considerable threats (Šmejkal et al. 2025).

Název v anglickém jazyce

Beyond the Net: Optimizing eDNA Sampling and Analysis for Challenging Muddy Habitats and the Endangered Weatherfish (Misgurnus fossilis)

Popis výsledku anglicky

Elusive and endangered species are prime candidates for environmental DNA (eDNA) monitoring (Duarte et al. 2023). The European weatherfish (Misgurnus fossilis) is one such species where traditional fishing methods may not yield conclusive results on its presence/absence. On the other hand, eDNA monitoring is less labour-intensive than conventional methods and may require only a small amount of water if species-specific qPCR/ddPCR markers are utilised (Thomsen et al. 2011, Sigsgaard et al. 2015, Kusanke et al. 2020, Brys et al. 2020). We aim to develop a standardised eDNA protocol that would provide additional information to traditional fishing surveys of Misgurnus . Such surveys are especially challenging in smaller vegetated waterbodies and wetlands in Central Europe where electrofishing, dip-netting, or fish trapping may not be feasible. As such, these wetland habitats are also among the most neglected European habitats despite facing considerable threats (Šmejkal et al. 2025).

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

10613 - Zoology

Projekt

<a href="/cs/project/SS07010366" target="_blank" >SS07010366: Genetická diverzita piskoře pruhovaného (Misgurnus fossilis) v ČR – poskytnutí zásadních dat pro ochranářská opatření mizejícího, kriticky ohroženého druhu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2025

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

ARPHA Conference Abstracts

ISBN

—

ISSN

2603-3925

e-ISSN

2603-3925

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

e180307

Název nakladatele

ARPHA

Místo vydání

-

Místo konání akce

Vídeň

Datum konání akce

23. 10. 2025

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—