Contrasting patterns of evolution of 45S and 5S rDNA families uncover new aspects in the genome constitution of the agronomically important grass Thinopyrum intermedium (Triticeae)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985939%3A_____%2F13%3A00395682" target="_blank" >RIV/67985939:_____/13:00395682 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61389030:_____/13:00395682
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/molbev/mst106" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/molbev/mst106</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/molbev/mst106" target="_blank" >10.1093/molbev/mst106</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Contrasting patterns of evolution of 45S and 5S rDNA families uncover new aspects in the genome constitution of the agronomically important grass Thinopyrum intermedium (Triticeae)
Popis výsledku v původním jazyce
Sequence variation and genomic organization of 45S and 5S rDNA families in the allohexaploid grass Thinopyrum intermedium showed that both families have undergone different patterns of evolution. ITS sequences residing within the arrays of two subgenomesout of three got homogenized towards one major ribotype, while the third subgenome contained a minor proportion of distinct unhomogenized copies. Homogenization mechanisms such as unequal crossover and/or gene conversion were coupled with the loss of certain 45S rDNA loci. Unlike in the 45S family, the data suggest that neither interlocus homogenization among homeologous chromosomes nor locus loss occurred in 5S rDNA. 5S sequences suggested the contributions from Aegilops to the intermediate wheatgrass? genome, which is a new finding with implications in wheat improvement.
Název v anglickém jazyce
Contrasting patterns of evolution of 45S and 5S rDNA families uncover new aspects in the genome constitution of the agronomically important grass Thinopyrum intermedium (Triticeae)
Popis výsledku anglicky
Sequence variation and genomic organization of 45S and 5S rDNA families in the allohexaploid grass Thinopyrum intermedium showed that both families have undergone different patterns of evolution. ITS sequences residing within the arrays of two subgenomesout of three got homogenized towards one major ribotype, while the third subgenome contained a minor proportion of distinct unhomogenized copies. Homogenization mechanisms such as unequal crossover and/or gene conversion were coupled with the loss of certain 45S rDNA loci. Unlike in the 45S family, the data suggest that neither interlocus homogenization among homeologous chromosomes nor locus loss occurred in 5S rDNA. 5S sequences suggested the contributions from Aegilops to the intermediate wheatgrass? genome, which is a new finding with implications in wheat improvement.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EF - Botanika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA13-04454S" target="_blank" >GA13-04454S: Cizorodý genetický materiál v genomu Elymus repens a ostatních Triticeae: jeho charakteristika, původ a evoluční význam.</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Molecular Biology and Evolution
ISSN
0737-4038
e-ISSN
—
Svazek periodika
30
Číslo periodika v rámci svazku
9
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
22
Strana od-do
2065-2086
Kód UT WoS článku
000323616600007
EID výsledku v databázi Scopus
—