Vysoce afinitní vazba nádorově supresorového proteinu p53 a HMGB1 s hemikatenátovými smyčkami DNA

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F04%3A00104679" target="_blank" >RIV/68081707:_____/04:00104679 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

High-affinity binding of tumor supressor protein p53 and HMGB1 protein to hemicatenated DNA loops

Popis výsledku v původním jazyce

We have observed that chromatin architectural protein HMGB1 and tumor suppressor protein p53 could bind with high affinity to a novel DNA structure that forms a DNA loop maintained at its base by a hemicatenane (termed hcDNA). The affinity of p53 for hcDNA is 40-fold higher (Kd ~ 0.5 nM) than for its natural specific binding sites within its target genes (Mdm2 promoter). Binding of p53 to hcDNA remains detectable in the presence of up to ~4 orders of magnitude of mass excess of competitor linear DNA, suggesting a high specificity of the interaction. p53 displays a higher affinity for hcDNA than for DNA minicircles (lacking functional p53-specific binding sequence) with a size similar to that of the loop within the hcDNA, indicating that the extreme affinity of p53 for hcDNA is likely due to binding of the protein to the hemicatenane. Only the full-length p53 can form stable ternary complexes with hcDNA and HMGB1.

Název v anglickém jazyce

High-affinity binding of tumor supressor protein p53 and HMGB1 protein to hemicatenated DNA loops

Popis výsledku anglicky

We have observed that chromatin architectural protein HMGB1 and tumor suppressor protein p53 could bind with high affinity to a novel DNA structure that forms a DNA loop maintained at its base by a hemicatenane (termed hcDNA). The affinity of p53 for hcDNA is 40-fold higher (Kd ~ 0.5 nM) than for its natural specific binding sites within its target genes (Mdm2 promoter). Binding of p53 to hcDNA remains detectable in the presence of up to ~4 orders of magnitude of mass excess of competitor linear DNA, suggesting a high specificity of the interaction. p53 displays a higher affinity for hcDNA than for DNA minicircles (lacking functional p53-specific binding sequence) with a size similar to that of the loop within the hcDNA, indicating that the extreme affinity of p53 for hcDNA is likely due to binding of the protein to the hemicatenane. Only the full-length p53 can form stable ternary complexes with hcDNA and HMGB1.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Biochemistry

ISSN

0006-2960

e-ISSN

—

Svazek periodika

43

Číslo periodika v rámci svazku

22

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

11

Strana od-do

7215-7225

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—