Konformační vlastnosti molekul DNA obsahujících trinukleotidová opakování (CCA)n a (TGG)n

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F05%3A00001183" target="_blank" >RIV/68081707:_____/05:00001183 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Conformational properties of DNA containing (CCA)n and (TGG)n trinucleotide repeats

Popis výsledku v původním jazyce

The (CCA)n fragments are random single strands at neutral and alkaline pH but they fold into intramolecular intercalated cytosine tetraplexes at mildly acid pH values. More acid values stabilize intermolecular tetraplex formation. The (TGG)n repeats formhairpins or antiparallel homoduplexes in low salt solutions which, however, are transformed into parallel-stranded guanine tetraplexes at physiological KCl concentrations. Their molecularity depends on the repeat number. The only (TGG)7 folds into an antiparallel-stranded intramolecular tetraplex at low KCl concentrations. Moreover, the (TGG)n fragments provide various mutually slipped conformers. However, both (TGG)n and (CCA)n prefer to associate into the classical heteroduplex. We suppose that the extreme conformational variability of the DNA strands stands behind the length polymorphism which the (CCA)n/(TGG)n repeats exhibit in the human genome.

Název v anglickém jazyce

Conformational properties of DNA containing (CCA)n and (TGG)n trinucleotide repeats

Popis výsledku anglicky

The (CCA)n fragments are random single strands at neutral and alkaline pH but they fold into intramolecular intercalated cytosine tetraplexes at mildly acid pH values. More acid values stabilize intermolecular tetraplex formation. The (TGG)n repeats formhairpins or antiparallel homoduplexes in low salt solutions which, however, are transformed into parallel-stranded guanine tetraplexes at physiological KCl concentrations. Their molecularity depends on the repeat number. The only (TGG)7 folds into an antiparallel-stranded intramolecular tetraplex at low KCl concentrations. Moreover, the (TGG)n fragments provide various mutually slipped conformers. However, both (TGG)n and (CCA)n prefer to associate into the classical heteroduplex. We suppose that the extreme conformational variability of the DNA strands stands behind the length polymorphism which the (CCA)n/(TGG)n repeats exhibit in the human genome.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

International Journal of Biological Macromolecules

ISSN

0141-8130

e-ISSN

—

Svazek periodika

36

Číslo periodika v rámci svazku

-

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

23-32

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—