Jsou vodíkové vazby RNA (.U) silnější než DNA (A.T)? Kvantově-mechanická studie

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F05%3A00021195" target="_blank" >RIV/68081707:_____/05:00021195 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Are the hydrogen bonds of RNA (.U) stronger than those of DNA (A.T)? A quantum mechanics study

Popis výsledku v původním jazyce

The intrinsic stabilita of Watson-Crick d(A.T) and r(A.U) hydrogen bonds was analyzed by employing a variety of quantum-mechanical techniques, such as energy calculations, determination of reactivity indexes, and analysis of electron density topology. The analyses was performed on equilibrium gas phase geometries and for hundreds of conformations derived from molecular dynamics (MD) and database analysis. None of our results support the idea that r(A.U) hydrogen bonds are more stable than d(A.T). Instead our data are in accordance with traditional view that the greater stability of RNA relative to DNA is attributable to a variety of effects (e.g. stacking, sugar puckering, solvation etc.).

Název v anglickém jazyce

Are the hydrogen bonds of RNA (.U) stronger than those of DNA (A.T)? A quantum mechanics study

Popis výsledku anglicky

The intrinsic stabilita of Watson-Crick d(A.T) and r(A.U) hydrogen bonds was analyzed by employing a variety of quantum-mechanical techniques, such as energy calculations, determination of reactivity indexes, and analysis of electron density topology. The analyses was performed on equilibrium gas phase geometries and for hundreds of conformations derived from molecular dynamics (MD) and database analysis. None of our results support the idea that r(A.U) hydrogen bonds are more stable than d(A.T). Instead our data are in accordance with traditional view that the greater stability of RNA relative to DNA is attributable to a variety of effects (e.g. stacking, sugar puckering, solvation etc.).

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA203%2F05%2F0009" target="_blank" >GA203/05/0009: Struktura a dynamika bází, párů bází nukleových kyselin, oligonukleotidů a jejich komplexů s vodou, ionty a léčivy</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemistry European Journal

ISSN

0947-6539

e-ISSN

—

Svazek periodika

11

Číslo periodika v rámci svazku

17

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

5062-5066

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—