Jednopovrchový elektrochemický biosenzor pro detekci expanze trinukleotidových opakování
Popis výsledku
Molekulární diagnostika dědičných neurodegenerativních onemocnění jako je Friedreichova ataxie (FRDA) je založena na analýze délky trinukleotidových opakujících se sekvencí genomové DNA. Délka těchto sekvencí může být detekována pomocí jednopovrchové techniky zahrnující několikanásobnou hybridizaci expandovaných trinukleotidových opakování s krátkou značenou sondou. Cílová DNA (tDNA) je adsorbována ne povrch uhlíkové elektrody. Sonda značená biotinem je hybridizována s imobilizovanou tDNA, poté následuje vazba konjugátu streptavidinu s alkalickou fosfatázou (ALP). ALP katalyzuje vznik elektroaktivního indikátoru (1-naftol), který je detekován voltametricky na stejné elektrodě. Zde je ukázána detekce expanze trinukleotidových opakování (GAA)n . (TTC)n vPCR-amplifikovaných tDNA, včetně aplikonů genomové DNA pacientů. Pomocí této techniky jsme schopni rozlišit normální a patologické alely genu X25, které souvisí s FRDA.
Klíčová slova
DNA hybridizationelectrochemical biosensorenzyme-linked assay
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216275:25310/06:00004082
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
A single-surface electrochemical biosensor for the detection of DNA triplet repeat expansion
Popis výsledku v původním jazyce
Molecular diagnostics of inherited neurodegenerative disorders such as Friedreich ataxia (FRDA) is based on analysis of the length of trinucleotide repetitive sequences in genomic DNA. Length of a triplet repetitive DNA sequence can be determined using asingle-surface technique involving multiple hybridization of the expanded triplet repeat with short labeled reporter probe. Target DNA (tDNA) is adsorbed onto surface of a carbon electrode. Biotin-labeled reporter probe is hybridized with the immobilized tDNA followed by binding of streptavidinalkaline phosphatase (ALP) conjugate. The ALP catalyzes production of an electroactive indicator (1-naphthol) which is detected voltammetrically on the same electrode. Detection of (GAA)n . (TTC)n triplet repeatexpansion in nanogram quantities of PCR-amplified tDNAs, including amplicons of patients genomic DNA, is demonstrated.
Název v anglickém jazyce
A single-surface electrochemical biosensor for the detection of DNA triplet repeat expansion
Popis výsledku anglicky
Molecular diagnostics of inherited neurodegenerative disorders such as Friedreich ataxia (FRDA) is based on analysis of the length of trinucleotide repetitive sequences in genomic DNA. Length of a triplet repetitive DNA sequence can be determined using asingle-surface technique involving multiple hybridization of the expanded triplet repeat with short labeled reporter probe. Target DNA (tDNA) is adsorbed onto surface of a carbon electrode. Biotin-labeled reporter probe is hybridized with the immobilized tDNA followed by binding of streptavidinalkaline phosphatase (ALP) conjugate. The ALP catalyzes production of an electroactive indicator (1-naphthol) which is detected voltammetrically on the same electrode. Detection of (GAA)n . (TTC)n triplet repeatexpansion in nanogram quantities of PCR-amplified tDNAs, including amplicons of patients genomic DNA, is demonstrated.
Klasifikace
Druh
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2006
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Electroanalysis
ISSN
1040-0397
e-ISSN
—
Svazek periodika
18
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
DE - Spolková republika Německo
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
141-151
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—
Základní informace
Druh výsledku
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP
BO - Biofyzika
Rok uplatnění
2006