Fishing for G-Quadruplexes in Solution with a Perylene Diimide Derivative Labeled with Biotins

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F18%3A00495172" target="_blank" >RIV/68081707:_____/18:00495172 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1002/chem.201802365" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/chem.201802365</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1002/chem.201802365" target="_blank" >10.1002/chem.201802365</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Fishing for G-Quadruplexes in Solution with a Perylene Diimide Derivative Labeled with Biotins

Popis výsledku v původním jazyce

A new fluorescent, non-cytotoxic perylene diimide derivative with two biotins at the peri position, PDI2B, has been synthesized. This molecule is able to interact selectively with G-quadruplexes with scarce or no affinity towards single- or double-stranded DNA. These features have made it possible to design a simple, effective, safe, cheap, and selective method for fishing G-quadruplex structures in solution by use of PDI2B and streptavidin coated magnetic beads. The new cyclic method reported leads to the recovery of more than 80% of G-quadruplex structures from solution, even in the presence of an excess of single-stranded or duplex DNA as competitors. Moreover, PDI2B is a G4 ligand that can display higher thermal stabilization and greater affinity for 2- over 3-tetrad quadruplexes, which constitutes a novel type of behavior.

Název v anglickém jazyce

Fishing for G-Quadruplexes in Solution with a Perylene Diimide Derivative Labeled with Biotins

Popis výsledku anglicky

A new fluorescent, non-cytotoxic perylene diimide derivative with two biotins at the peri position, PDI2B, has been synthesized. This molecule is able to interact selectively with G-quadruplexes with scarce or no affinity towards single- or double-stranded DNA. These features have made it possible to design a simple, effective, safe, cheap, and selective method for fishing G-quadruplex structures in solution by use of PDI2B and streptavidin coated magnetic beads. The new cyclic method reported leads to the recovery of more than 80% of G-quadruplex structures from solution, even in the presence of an excess of single-stranded or duplex DNA as competitors. Moreover, PDI2B is a G4 ligand that can display higher thermal stabilization and greater affinity for 2- over 3-tetrad quadruplexes, which constitutes a novel type of behavior.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/EF15_003%2F0000477" target="_blank" >EF15_003/0000477: Strukturní gymnastika nukleových kyselin: od molekulárních principů přes biologické funkce k terapeutickým cílům.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemistry - A European Journal

ISSN

0947-6539

e-ISSN

—

Svazek periodika

24

Číslo periodika v rámci svazku

44

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

11292-11296

Kód UT WoS článku

000440908500009

EID výsledku v databázi Scopus

—