Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Electrochemical Detection of SNP in Human Mitochondrial DNA Using Cyclic Primer Extension with Biotinylated Nucletides and Enzymatic Labeling at Disposable Pencil Graphite Electrodes

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F18%3A00502202" target="_blank" >RIV/68081707:_____/18:00502202 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/elan.201800314" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/elan.201800314</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/elan.201800314" target="_blank" >10.1002/elan.201800314</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Electrochemical Detection of SNP in Human Mitochondrial DNA Using Cyclic Primer Extension with Biotinylated Nucletides and Enzymatic Labeling at Disposable Pencil Graphite Electrodes

  • Popis výsledku v původním jazyce

    A novel method of SNP typing in human mitochondrial DNA utilizing enzymatic labeling and electrochemical detection at disposable pencil graphite electrodes is described. The procedure is based on amplification of DNA stretches by cyclic primer extension (PEx) of SNP-specific diagnostic primers in a mixture of biotinylated and natural nucleotides. The diagnostic primers are designed to recognize, by its 3'-terminal nucleotide, the SNP-site in target template. Under optimized conditions of the PEx reaction, efficient polymerase synthesis of biotin-labeled strands takes place only in the case of full complementarity between the diagnostic primer and the target SNP site. There is also benefit from introducing many biotin molecules per extended DNA strand, resulting in another level of signal amplification. After adsorption of biotinylated PEx products at the electrode surface, streptavidin-alkaline phosphatase conjugate was bound to the biotin tags, 1-naphthol was enzymatically produced and electrochemically detected. Several critical steps and parameters of the assay, including termination of 3'-OH ends of residual amplification primers, temperature for annealing of diagnostic primers, relative amount of biotinylated deoxynucleoside triphosphate in the PEx mixture and number of PEx cycles were optimized in this study to attain best SNP resolution, and reduction of time needed for the analysis.

  • Název v anglickém jazyce

    Electrochemical Detection of SNP in Human Mitochondrial DNA Using Cyclic Primer Extension with Biotinylated Nucletides and Enzymatic Labeling at Disposable Pencil Graphite Electrodes

  • Popis výsledku anglicky

    A novel method of SNP typing in human mitochondrial DNA utilizing enzymatic labeling and electrochemical detection at disposable pencil graphite electrodes is described. The procedure is based on amplification of DNA stretches by cyclic primer extension (PEx) of SNP-specific diagnostic primers in a mixture of biotinylated and natural nucleotides. The diagnostic primers are designed to recognize, by its 3'-terminal nucleotide, the SNP-site in target template. Under optimized conditions of the PEx reaction, efficient polymerase synthesis of biotin-labeled strands takes place only in the case of full complementarity between the diagnostic primer and the target SNP site. There is also benefit from introducing many biotin molecules per extended DNA strand, resulting in another level of signal amplification. After adsorption of biotinylated PEx products at the electrode surface, streptavidin-alkaline phosphatase conjugate was bound to the biotin tags, 1-naphthol was enzymatically produced and electrochemically detected. Several critical steps and parameters of the assay, including termination of 3'-OH ends of residual amplification primers, temperature for annealing of diagnostic primers, relative amount of biotinylated deoxynucleoside triphosphate in the PEx mixture and number of PEx cycles were optimized in this study to attain best SNP resolution, and reduction of time needed for the analysis.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GBP206%2F12%2FG151" target="_blank" >GBP206/12/G151: Centrum nových přístupů k bioanalýze a molekulární diagnostice</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Electroanalysis

  • ISSN

    1040-0397

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    30

  • Číslo periodika v rámci svazku

    10

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    2321-2329

  • Kód UT WoS článku

    000446660400016

  • EID výsledku v databázi Scopus