Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Fluorescent light-up acridine orange derivatives bind and stabilize KRAS-22RT G-quadruplex

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F18%3A00506876" target="_blank" >RIV/68081707:_____/18:00506876 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0300908417302845?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0300908417302845?via%3Dihub</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.biochi.2017.11.004" target="_blank" >10.1016/j.biochi.2017.11.004</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Fluorescent light-up acridine orange derivatives bind and stabilize KRAS-22RT G-quadruplex

  • Popis výsledku v původním jazyce

    KRAS is often found mutated in lethal cancers and should be an important target for anticancer drug development. However, no effective inhibitor has been reported so far, prompting the scientific community to describe the RAS proteins as nearly ´undruggable´. Recent approaches developed to modulate KRAS protein expression comprises the targeting of G-quadruplex (G4) structures formed within the nuclease hypersensitive element of KRAS promoter region, by designing small and specific ligands to stabilize the tertiary fold and reduce gene expression. In this work, we report in vitro and in silico studies of novel acridine orange (AO) derivatives (C-3-C-8), developed as G4 stabilizing agents. The results show that the ligands bind with high affinity and stabilize KRAS22-RT G4 with modest specificity over duplex DNA. The most promising ligand C-8 stabilizes the structure by approximate to 40 degrees C. Molecular docking using NMR-derived distance restraints reveal atomic details about the ligand structural features in the interaction with KRAS22-RT G4. In vitro studies with HeLa cells show that the ligands are cytotoxic with IC50 values between 0.9 mu M and 5.7 mu M. Moreover, the ligands tend to localize in the nucleus as shown by confocal fluorescence microscopy. Overall, these results show that the reported AO ligands display favourable properties as G4 ligands and this study provides structural detail for the development of lead KRAS G4 ligands. (C) 2017 Elsevier B.V. and Societe Francaise de Biochimie et Biologie Moleculaire (SFBBM). All rights reserved.

  • Název v anglickém jazyce

    Fluorescent light-up acridine orange derivatives bind and stabilize KRAS-22RT G-quadruplex

  • Popis výsledku anglicky

    KRAS is often found mutated in lethal cancers and should be an important target for anticancer drug development. However, no effective inhibitor has been reported so far, prompting the scientific community to describe the RAS proteins as nearly ´undruggable´. Recent approaches developed to modulate KRAS protein expression comprises the targeting of G-quadruplex (G4) structures formed within the nuclease hypersensitive element of KRAS promoter region, by designing small and specific ligands to stabilize the tertiary fold and reduce gene expression. In this work, we report in vitro and in silico studies of novel acridine orange (AO) derivatives (C-3-C-8), developed as G4 stabilizing agents. The results show that the ligands bind with high affinity and stabilize KRAS22-RT G4 with modest specificity over duplex DNA. The most promising ligand C-8 stabilizes the structure by approximate to 40 degrees C. Molecular docking using NMR-derived distance restraints reveal atomic details about the ligand structural features in the interaction with KRAS22-RT G4. In vitro studies with HeLa cells show that the ligands are cytotoxic with IC50 values between 0.9 mu M and 5.7 mu M. Moreover, the ligands tend to localize in the nucleus as shown by confocal fluorescence microscopy. Overall, these results show that the reported AO ligands display favourable properties as G4 ligands and this study provides structural detail for the development of lead KRAS G4 ligands. (C) 2017 Elsevier B.V. and Societe Francaise de Biochimie et Biologie Moleculaire (SFBBM). All rights reserved.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF15_003%2F0000477" target="_blank" >EF15_003/0000477: Strukturní gymnastika nukleových kyselin: od molekulárních principů přes biologické funkce k terapeutickým cílům.</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Biochimie

  • ISSN

    0300-9084

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    144

  • Číslo periodika v rámci svazku

    JAN 2018

  • Stát vydavatele periodika

    FR - Francouzská republika

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    144-152

  • Kód UT WoS článku

    000418496400016

  • EID výsledku v databázi Scopus