Systematic investigation of sequence requirements for DNA i-motif formation.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F19%3A00502911" target="_blank" >RIV/68081707:_____/19:00502911 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://academic.oup.com/nar/article-pdf/47/5/2177/28041982/gkz046.pdf" target="_blank" >https://academic.oup.com/nar/article-pdf/47/5/2177/28041982/gkz046.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkz046" target="_blank" >10.1093/nar/gkz046</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Systematic investigation of sequence requirements for DNA i-motif formation.
Popis výsledku v původním jazyce
The formation of intercalated motifs (iMs) - secondary DNA structures based on hemiprotonated C.C+ pairs in suitable cytosine-rich DNA sequences, is reflected by typical changes in CD and UV absorption spectra. By means of spectroscopic methods, electrophoresis, chemical modifications and other procedures, we characterized iM formation and stability in sequences with different cytosine block lengths interrupted by various numbers and types of nucleotides. Particular attention was paid to the formation of iMs at pH conditions close to neutral. We identified the optimal conditions and minimal requirements for iM formation in DNA sequences, and addressed gaps and inaccurate data interpretations in existing studies to specify principles of iM formation and modes of their folding.
Název v anglickém jazyce
Systematic investigation of sequence requirements for DNA i-motif formation.
Popis výsledku anglicky
The formation of intercalated motifs (iMs) - secondary DNA structures based on hemiprotonated C.C+ pairs in suitable cytosine-rich DNA sequences, is reflected by typical changes in CD and UV absorption spectra. By means of spectroscopic methods, electrophoresis, chemical modifications and other procedures, we characterized iM formation and stability in sequences with different cytosine block lengths interrupted by various numbers and types of nucleotides. Particular attention was paid to the formation of iMs at pH conditions close to neutral. We identified the optimal conditions and minimal requirements for iM formation in DNA sequences, and addressed gaps and inaccurate data interpretations in existing studies to specify principles of iM formation and modes of their folding.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10610 - Biophysics
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Nucleic Acids Research
ISSN
1362-4962
e-ISSN
—
Svazek periodika
47
Číslo periodika v rámci svazku
MAR2019
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
2177-2189
Kód UT WoS článku
000467963700010
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85062859535