Unique Epigenetic Features of Ribosomal RNA Genes (rDNA) in Early Diverging Plants (Bryophytes)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F19%3A00518325" target="_blank" >RIV/68081707:_____/19:00518325 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216224:14310/19:00107639
Výsledek na webu
<a href="https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.01066/pdf" target="_blank" >https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2019.01066/pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2019.01066" target="_blank" >10.3389/fpls.2019.01066</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Unique Epigenetic Features of Ribosomal RNA Genes (rDNA) in Early Diverging Plants (Bryophytes)
Popis výsledku v původním jazyce
Introduction: In plants, the multicopy genes encoding ribosomal RNA (rDNA) typically exhibit heterochromatic features and high level of DNA methylation. Here, we explored rDNA methylation in early diverging land plants from Bryophyta (15 species, 14 families) and Marchantiophyta (4 species, 4 families). DNA methylation was investigated by methylation-sensitive Southern blot hybridization in all species. We also carried out whole genomic bisulfite sequencing in Polytrichum formosum (Polytrichaceae) and Dicranum scoparium (Dicranaceae) and used available model plant methyloms (Physcomitrella patents and Marchantia polymorpha) to determine rDNA unit-wide methylation patterns. Chromatin structure was analyzed using fluorescence in situ hybridization (FISH) and immunoprecipitation (CHIP) assays.
Název v anglickém jazyce
Unique Epigenetic Features of Ribosomal RNA Genes (rDNA) in Early Diverging Plants (Bryophytes)
Popis výsledku anglicky
Introduction: In plants, the multicopy genes encoding ribosomal RNA (rDNA) typically exhibit heterochromatic features and high level of DNA methylation. Here, we explored rDNA methylation in early diverging land plants from Bryophyta (15 species, 14 families) and Marchantiophyta (4 species, 4 families). DNA methylation was investigated by methylation-sensitive Southern blot hybridization in all species. We also carried out whole genomic bisulfite sequencing in Polytrichum formosum (Polytrichaceae) and Dicranum scoparium (Dicranaceae) and used available model plant methyloms (Physcomitrella patents and Marchantia polymorpha) to determine rDNA unit-wide methylation patterns. Chromatin structure was analyzed using fluorescence in situ hybridization (FISH) and immunoprecipitation (CHIP) assays.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10611 - Plant sciences, botany
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Frontiers in Plant Science
ISSN
1664-462X
e-ISSN
—
Svazek periodika
10
Číslo periodika v rámci svazku
SEP 5 2019
Stát vydavatele periodika
CH - Švýcarská konfederace
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
1066
Kód UT WoS článku
000483927200001
EID výsledku v databázi Scopus
—