Combining NMR Spectroscopy and Molecular Dynamic Simulations to Solve and Analyze the Structure of Protein-RNA Complexes
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F19%3A00520492" target="_blank" >RIV/68081707:_____/19:00520492 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0076687918303598?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0076687918303598?via%3Dihub</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/bs.mie.2018.09.002" target="_blank" >10.1016/bs.mie.2018.09.002</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Combining NMR Spectroscopy and Molecular Dynamic Simulations to Solve and Analyze the Structure of Protein-RNA Complexes
Popis výsledku v původním jazyce
Understanding the RNA binding specificity of protein is of primary interest to decipher their function in the cell. Here, we review the methodology used to solve the structures of protein-RNA complexes using solution-state NMR spectroscopy: from sample preparation to structure calculation procedures. We also describe how molecular dynamics simulations can help providing additional information on the role of key amino acid side chains and of water molecules in protein-RNA recognition.
Název v anglickém jazyce
Combining NMR Spectroscopy and Molecular Dynamic Simulations to Solve and Analyze the Structure of Protein-RNA Complexes
Popis výsledku anglicky
Understanding the RNA binding specificity of protein is of primary interest to decipher their function in the cell. Here, we review the methodology used to solve the structures of protein-RNA complexes using solution-state NMR spectroscopy: from sample preparation to structure calculation procedures. We also describe how molecular dynamics simulations can help providing additional information on the role of key amino acid side chains and of water molecules in protein-RNA recognition.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Methods in Enzymology
ISSN
0076-6879
e-ISSN
—
Svazek periodika
614
Číslo periodika v rámci svazku
2019
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
30
Strana od-do
393-422
Kód UT WoS článku
000500377800015
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85057952772