Electroanalysis of unnatural base pair content in plasmid DNA generated in a semi-synthetic organism
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F20%3A00536183" target="_blank" >RIV/68081707:_____/20:00536183 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216224:14740/20:00114754
Výsledek na webu
<a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0013468620316911?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0013468620316911?via%3Dihub</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.electacta.2020.137298" target="_blank" >10.1016/j.electacta.2020.137298</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Electroanalysis of unnatural base pair content in plasmid DNA generated in a semi-synthetic organism
Popis výsledku v původním jazyce
While standard Watson-Crick base pairing normally involves hydrogen bonds that join size complemen-tary nitrogenous heterocycles, certain unnatural base pairs (UBP) can support replication, transcription, and translation, including these in semi-synthetic organisms (SSO), using size complementarity alone. In this paper we show that the UBPs can be analyzed electrochemically as components of riboor 2'-deoxyribonucleosides, corresponding (2'-deoxy)triphosphates, as well as incorporated into DNA. Here, performance of the electrochemical methods profits from the ability of the unnatural bases 5SICS and TPT3 adsorbed at the surface of a mercury electrode to catalyze hydrogen evolution in acidic media. This allows semi-quantitative detection of single UBP within plasmid DNA generated in a SSO. This electrochemical approach provides new way for direct, fast, and low cost UBP analysis and can supplement or replace currently used methods of UBP detection. (C) 2020 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Název v anglickém jazyce
Electroanalysis of unnatural base pair content in plasmid DNA generated in a semi-synthetic organism
Popis výsledku anglicky
While standard Watson-Crick base pairing normally involves hydrogen bonds that join size complemen-tary nitrogenous heterocycles, certain unnatural base pairs (UBP) can support replication, transcription, and translation, including these in semi-synthetic organisms (SSO), using size complementarity alone. In this paper we show that the UBPs can be analyzed electrochemically as components of riboor 2'-deoxyribonucleosides, corresponding (2'-deoxy)triphosphates, as well as incorporated into DNA. Here, performance of the electrochemical methods profits from the ability of the unnatural bases 5SICS and TPT3 adsorbed at the surface of a mercury electrode to catalyze hydrogen evolution in acidic media. This allows semi-quantitative detection of single UBP within plasmid DNA generated in a SSO. This electrochemical approach provides new way for direct, fast, and low cost UBP analysis and can supplement or replace currently used methods of UBP detection. (C) 2020 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Electrochimica acta
ISSN
0013-4686
e-ISSN
—
Svazek periodika
364
Číslo periodika v rámci svazku
Dec 20 2020
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
137298
Kód UT WoS článku
000591743600004
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85094117417