Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Role of folding kinetics of secondary structures in telomeric G-overhangs in the regulation of telomere maintenance inSaccharomyces cerevisiae

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F20%3A00539336" target="_blank" >RIV/68081707:_____/20:00539336 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216224:14740/20:00114648

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925817503208?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021925817503208?via%3Dihub</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1074/jbc.RA120.012914" target="_blank" >10.1074/jbc.RA120.012914</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Role of folding kinetics of secondary structures in telomeric G-overhangs in the regulation of telomere maintenance inSaccharomyces cerevisiae

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The ends of eukaryotic chromosomes typically contain a 3? ssDNA G-rich protrusion (G-overhang). This overhang must be protected against detrimental activities of nucleases and of the DNA damage response machinery and participates in the regulation of telomerase, a ribonucleoprotein complex that maintains telomere integrity. These functions are mediated by DNA-binding proteins, such as Cdc13 inSaccharomyces cerevisiae, and the propensity of G-rich sequences to form various non-B DNA structures. Using CD and NMR spectroscopies, we show here that G-overhangs ofS. cerevisiaeform distinct Hoogsteen pairing?based secondary structures, depending on their length. Whereas short telomeric oligonucleotides form a G-hairpin, their longer counterparts form parallel and/or antiparallel G-quadruplexes (G4s). Regardless of their topologies, non-B DNA structures exhibited impaired binding to Cdc13in vitroas demonstrated by electrophoretic mobility shift assays. Importantly, whereas G4 structures formed relatively quickly, G-hairpins folded extremely slowly, indicating that short G-overhangs, which are typical for most of the cell cycle, are present predominantly as single-stranded oligonucleotides and are suitable substrates for Cdc13. Using ChIP, we show that the occurrence of G4 structures peaks at the late S phase, thus correlating with the accumulation of long G-overhangs. We present a model of how time- and length-dependent formation of non-B DNA structures at chromosomal termini participates in telomere maintenance.

  • Název v anglickém jazyce

    Role of folding kinetics of secondary structures in telomeric G-overhangs in the regulation of telomere maintenance inSaccharomyces cerevisiae

  • Popis výsledku anglicky

    The ends of eukaryotic chromosomes typically contain a 3? ssDNA G-rich protrusion (G-overhang). This overhang must be protected against detrimental activities of nucleases and of the DNA damage response machinery and participates in the regulation of telomerase, a ribonucleoprotein complex that maintains telomere integrity. These functions are mediated by DNA-binding proteins, such as Cdc13 inSaccharomyces cerevisiae, and the propensity of G-rich sequences to form various non-B DNA structures. Using CD and NMR spectroscopies, we show here that G-overhangs ofS. cerevisiaeform distinct Hoogsteen pairing?based secondary structures, depending on their length. Whereas short telomeric oligonucleotides form a G-hairpin, their longer counterparts form parallel and/or antiparallel G-quadruplexes (G4s). Regardless of their topologies, non-B DNA structures exhibited impaired binding to Cdc13in vitroas demonstrated by electrophoretic mobility shift assays. Importantly, whereas G4 structures formed relatively quickly, G-hairpins folded extremely slowly, indicating that short G-overhangs, which are typical for most of the cell cycle, are present predominantly as single-stranded oligonucleotides and are suitable substrates for Cdc13. Using ChIP, we show that the occurrence of G4 structures peaks at the late S phase, thus correlating with the accumulation of long G-overhangs. We present a model of how time- and length-dependent formation of non-B DNA structures at chromosomal termini participates in telomere maintenance.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Biological Chemistry

  • ISSN

    0021-9258

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    295

  • Číslo periodika v rámci svazku

    27

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    14

  • Strana od-do

    8958-8971

  • Kód UT WoS článku

    000550698000007

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85087532995