Mitogenomics of the endemic Ethiopian rats: looking for footprints of adaptive evolution in sky islands
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081766%3A_____%2F21%3A00538392" target="_blank" >RIV/68081766:_____/21:00538392 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216224:14310/21:00123283
Výsledek na webu
<a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567724920302464?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567724920302464?via%3Dihub</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.mito.2020.12.015" target="_blank" >10.1016/j.mito.2020.12.015</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Mitogenomics of the endemic Ethiopian rats: looking for footprints of adaptive evolution in sky islands
Popis výsledku v původním jazyce
Organisms living in high altitude must adapt to environmental conditions with hypoxia and low temperature, e.g. by changes in the structure and function of proteins associated with oxidative phosphorylation in mitochondria. Here we analysed the signs of adaptive evolution in 27 mitogenomes of endemic Ethiopian rats (Stenocephalemys), where individual species adapted to different elevation. Significant signals of positive selection were detected in 10 of the 13 mitochondrial protein-coding genes, with a majority of functional substitutions in the NADH dehydrogenase complex. Higher frequency of positively selected sites was found in phylogenetic lineages corresponding to Afroalpine specialists.
Název v anglickém jazyce
Mitogenomics of the endemic Ethiopian rats: looking for footprints of adaptive evolution in sky islands
Popis výsledku anglicky
Organisms living in high altitude must adapt to environmental conditions with hypoxia and low temperature, e.g. by changes in the structure and function of proteins associated with oxidative phosphorylation in mitochondria. Here we analysed the signs of adaptive evolution in 27 mitogenomes of endemic Ethiopian rats (Stenocephalemys), where individual species adapted to different elevation. Significant signals of positive selection were detected in 10 of the 13 mitochondrial protein-coding genes, with a majority of functional substitutions in the NADH dehydrogenase complex. Higher frequency of positively selected sites was found in phylogenetic lineages corresponding to Afroalpine specialists.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10613 - Zoology
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA18-17398S" target="_blank" >GA18-17398S: Evoluce na strmém gradientu nadmořské výšky: stanovení role genetických a ekologických faktorů v procesu vzniku druhů</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2021
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Mitochondrion
ISSN
1567-7249
e-ISSN
1872-8278
Svazek periodika
57
Číslo periodika v rámci svazku
March
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
182-191
Kód UT WoS článku
000647668600008
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85099820243