Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Genomic diversity, evolutionary history, and species limits of the endemic Ethiopian laminate-toothed rats (genus Otomys, Rodentia: Muridae)

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081766%3A_____%2F23%3A00578474" target="_blank" >RIV/68081766:_____/23:00578474 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216224:14310/23:00132158

  • Výsledek na webu

    <a href="https://academic.oup.com/zoolinnean/advance-article/doi/10.1093/zoolinnean/zlad063/7250553?login=true" target="_blank" >https://academic.oup.com/zoolinnean/advance-article/doi/10.1093/zoolinnean/zlad063/7250553?login=true</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/zoolinnean/zlad063" target="_blank" >10.1093/zoolinnean/zlad063</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Genomic diversity, evolutionary history, and species limits of the endemic Ethiopian laminate-toothed rats (genus Otomys, Rodentia: Muridae)

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The Ethiopian Highlands represent one of the most important centres of endemism on Earth. Six endemic species of laminate-toothed rats have been reported from Ethiopia in a previous study based mostly on morphological analyses. Largely missing genetic data for some of the species, insufficient sampling across Ethiopia, and presence of a pseudogene on cytochrome b created knowledge gaps in basic taxonomy, distribution, and phylogenetic position of the Ethiopian taxa. Here we perform an integrative taxonomic revision of the group by using the largest available sets of genomic and morphological data. We first reconstructed the mitochondrial phylogeny of the whole genus, delimited major clades, and evidenced two independent colonization events of Otomys to Ethiopia. By using genome-scale SNPs, we delimited putative Ethiopian species and analysed their phylogenetic relationships. In genetically characterized specimens we assessed morphological variation of skulls. We confirmed the presence of six previously reported species and significantly extended the known distributional range for some of them. Furthermore, we discovered a genetically and morphologically distinct lineage in northern Ethiopia, probably representing a new species. The speciation processes are similar to other Afromontane Ethiopian endemic rodent clades, with prevailing allopatric diversification combined with reticulate processes.

  • Název v anglickém jazyce

    Genomic diversity, evolutionary history, and species limits of the endemic Ethiopian laminate-toothed rats (genus Otomys, Rodentia: Muridae)

  • Popis výsledku anglicky

    The Ethiopian Highlands represent one of the most important centres of endemism on Earth. Six endemic species of laminate-toothed rats have been reported from Ethiopia in a previous study based mostly on morphological analyses. Largely missing genetic data for some of the species, insufficient sampling across Ethiopia, and presence of a pseudogene on cytochrome b created knowledge gaps in basic taxonomy, distribution, and phylogenetic position of the Ethiopian taxa. Here we perform an integrative taxonomic revision of the group by using the largest available sets of genomic and morphological data. We first reconstructed the mitochondrial phylogeny of the whole genus, delimited major clades, and evidenced two independent colonization events of Otomys to Ethiopia. By using genome-scale SNPs, we delimited putative Ethiopian species and analysed their phylogenetic relationships. In genetically characterized specimens we assessed morphological variation of skulls. We confirmed the presence of six previously reported species and significantly extended the known distributional range for some of them. Furthermore, we discovered a genetically and morphologically distinct lineage in northern Ethiopia, probably representing a new species. The speciation processes are similar to other Afromontane Ethiopian endemic rodent clades, with prevailing allopatric diversification combined with reticulate processes.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10613 - Zoology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GC20-07091J" target="_blank" >GC20-07091J: Drobní savci východoafrických hor: evoluce rozmanitosti a endemismu v jednom z celosvětově nejdůležitějších center biodiverzity</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Zoological Journal of the Linnean Society

  • ISSN

    0024-4082

  • e-ISSN

    1096-3642

  • Svazek periodika

    199

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    19

  • Strana od-do

    1059-1077

  • Kód UT WoS článku

    001080369400001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85179833559