TwoPhotonProcessor - programový balík pro zpracování dat zobrazování vápníkových proudů in vivo
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378041%3A_____%2F11%3A00373516" target="_blank" >RIV/68378041:_____/11:00373516 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
TwoPhotonProcessor - programový balík pro zpracování dat zobrazování vápníkových proudů in vivo
Popis výsledku v původním jazyce
Softwarový balík může sloužit jako nástroj pro zpracování dat z in vivo calcium imagingu. Z naměřených dat lze v programu dále vytvořit např. receptivní pole a post-stimulační histogramy pro jednotlivé neurony. Softwarový balík byl optimalizován pro použití pro měření ve sluchové kůře drobných hlodavců, může být ale využit i pro měření v jiných částech CNS.
Název v anglickém jazyce
TwoPhotonProcessor - software package for processing of in vivo calcium imaging data
Popis výsledku anglicky
The software package can serve as a processing tool for data from in vivo calcium imaging. Neuronal receptive fields, post-stimulation histograms and astrocyte calcium data can be taken as an output. The software was optimized for usage in auditory cortex, but it is possible to use it in other parts of the CNS as well.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
FH - Neurologie, neurochirurgie, neurovědy
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA309%2F07%2F1336" target="_blank" >GA309/07/1336: Zpracování akustického signálu v neuronových okruzích sluchového systému</a><br>
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
TPP-1
Technické parametry
Programový balík pro zpracování dat zobrazování vápníkových proudů in vivo. Software je psaný jako provázané funkce v prostředí MATLAB. Pro běh programového balíku je nutné jádro MATLAB a Image Processing Toolbox (The MathWorks, Inc.)
Ekonomické parametry
Vytvořený programový balík umožňuje plně automatické zpracování dat vápníkových signálů z neuronových sítí a originálním způsobem koriguje pohybové artefakty. V některých částech tohoto procesu je algoritmizace nezbytná, v jiných částech šetří mnoho hodin lidské práce při získávání receptivních polí jednotlivých neuronů.
IČO vlastníka výsledku
68378041
Název vlastníka
Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.