Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Délková distribuce retroelementů LINE a procesovaných pseudogenů lidských endogenních retrovirů: implikace pro retrotranspozici a detekci pseudogenů

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F02%3A00108985" target="_blank" >RIV/68378050:_____/02:00108985 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Length distribution of long interspersed nuclear elements (LINEs) and processed pseudogenes of human endogenous retroviruses: implications for retrotransposition and pseudogene detection

  • Popis výsledku v původním jazyce

    We have analyzed the length distribution of LINEs and of processed pseudogenes derived from HERV-W. As expected, we have found that the majority of 5´ truncated LINEs and HERV-W processed pseudogenes show a prevalence of very short elements terminated close to the 3´ end. On the other hand, the number of complete elements is far above the expectation. The characteristic distribution in both cases indicates two important conclusions: (i) dissociation of LINE RT from the template cannot be fully explainedby low processivity of RT modelled as a stochastic, Poisson-type process. (ii) Currently cited numbers of pseudogenes within the human genome are underestimated, since a large percentage of pseudogenes are terminated in the 3´ untranslated region and remain undetectable in translated homology searches of protein databases against the human genome

  • Název v anglickém jazyce

    Length distribution of long interspersed nuclear elements (LINEs) and processed pseudogenes of human endogenous retroviruses: implications for retrotransposition and pseudogene detection

  • Popis výsledku anglicky

    We have analyzed the length distribution of LINEs and of processed pseudogenes derived from HERV-W. As expected, we have found that the majority of 5´ truncated LINEs and HERV-W processed pseudogenes show a prevalence of very short elements terminated close to the 3´ end. On the other hand, the number of complete elements is far above the expectation. The characteristic distribution in both cases indicates two important conclusions: (i) dissociation of LINE RT from the template cannot be fully explainedby low processivity of RT modelled as a stochastic, Poisson-type process. (ii) Currently cited numbers of pseudogenes within the human genome are underestimated, since a large percentage of pseudogenes are terminated in the 3´ untranslated region and remain undetectable in translated homology searches of protein databases against the human genome

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA204%2F01%2F0632" target="_blank" >GA204/01/0632: Vzorec methylace DNA regulačních sekvencí retrovirů</a><br>

  • Návaznosti

    Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2002

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Gene

  • ISSN

    0378-1119

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    300

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1-2

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    6

  • Strana od-do

    246-249

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus