Globální transkriptomová analýza varlat myší C57BL/6J metodou SAGE: průkaz nenáhodného uspořádání genů
Popis výsledku
Pomocí metody SAGE (sériová analýza genové exprese) byly vytvořeny genové expresní profily celých varlat dospělých myší kmene C57BL/6J. Byla provedena podrobná bioinformatická analýza SAGE transkriptomů celkového varlete a veřejně dostupných SAGE transkriptomů somatických buněk varlete a dalších sedmi somatických tkání. Geny exprimované v tkáních varlete vykazují nenáhodné uspořádání mezi autozomy a X chromozomem a také tendenci tvořit poziční klastry na chromozomech. Výsledky poskytují nový důkaz ve prospěch teorie o akumulaci samčích genů na X chromozomu v somatických buňkách varlete a ukazují protichůdné působení meiotické X inaktivace v germinálních buňkách varlete.
Klíčová slova
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Global transcriptome analysis of the C57BL/6J mouse testis by SAGE: evidence for nonrandom gene order
Popis výsledku v původním jazyce
Gene expression profiles of total testis of adult C57BL/6J mice were generated using serial analysis of gene expression (SAGE). An extensive bioinformatic analysis of the total testis SAGE transcriptome and publicly available SAGE transcriptomes of testicular somatic cells and seven non-testis tissues was performed. The genes expressed in testicular tissues exhibited non-random distribution between autosomes and the X chromosome as well as certain tendency to form positional clusters on chromosomes. Theresults provide new evidence in favor of the theory of male-biased genes accumulation on the X chromosome in testicular somatic cells and indicate the opposite action of the meiotic X-inactivation in testicular germ cells.
Název v anglickém jazyce
Global transcriptome analysis of the C57BL/6J mouse testis by SAGE: evidence for nonrandom gene order
Popis výsledku anglicky
Gene expression profiles of total testis of adult C57BL/6J mice were generated using serial analysis of gene expression (SAGE). An extensive bioinformatic analysis of the total testis SAGE transcriptome and publicly available SAGE transcriptomes of testicular somatic cells and seven non-testis tissues was performed. The genes expressed in testicular tissues exhibited non-random distribution between autosomes and the X chromosome as well as certain tendency to form positional clusters on chromosomes. Theresults provide new evidence in favor of the theory of male-biased genes accumulation on the X chromosome in testicular somatic cells and indicate the opposite action of the meiotic X-inactivation in testicular germ cells.
Klasifikace
Druh
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2005
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
B M C Genomics
ISSN
1471-2164
e-ISSN
—
Svazek periodika
6
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
17
Strana od-do
29-45
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—
Základní informace
Druh výsledku
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Rok uplatnění
2005