In vivo kinetics of U4/U6.U5 tri-snRNP formation in Cajal bodies
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F11%3A00355300" target="_blank" >RIV/68378050:_____/11:00355300 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68378041:_____/11:00355300 RIV/00216208:11320/11:10105570
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
In vivo kinetics of U4/U6.U5 tri-snRNP formation in Cajal bodies
Popis výsledku v původním jazyce
The U4/U6.U5 tri-snRNP is an essential pre-mRNA splicing factor, which is assembled in a step-wise manner before each round of splicing. It was previously shown that the tri-snRNP is formed in Cajal bodies (CBs) but little is known about the dynamics ofthis process. Here we created a mathematical model of tri-snRNP assembly in CBs and used it to fit kinetics of individual snRNPs monitored by fluorescence recovery after photobleaching (FRAP). A global fitting of all kinetic data determined key reactionconstants of tri-snRNP assembly. The rates of di-snRNP and tri-snRNP assemblies are similar and ca 230 tri-snRNPs are assembled in one CB per minute. Tri-snRNP assembly is about ten-fold faster in CBs than in the surrounding nucleoplasm, which is fully consistent with the importance of CBs for snRNP formation in rapidly developing biological systems.
Název v anglickém jazyce
In vivo kinetics of U4/U6.U5 tri-snRNP formation in Cajal bodies
Popis výsledku anglicky
The U4/U6.U5 tri-snRNP is an essential pre-mRNA splicing factor, which is assembled in a step-wise manner before each round of splicing. It was previously shown that the tri-snRNP is formed in Cajal bodies (CBs) but little is known about the dynamics ofthis process. Here we created a mathematical model of tri-snRNP assembly in CBs and used it to fit kinetics of individual snRNPs monitored by fluorescence recovery after photobleaching (FRAP). A global fitting of all kinetic data determined key reactionconstants of tri-snRNP assembly. The rates of di-snRNP and tri-snRNP assemblies are similar and ca 230 tri-snRNPs are assembled in one CB per minute. Tri-snRNP assembly is about ten-fold faster in CBs than in the surrounding nucleoplasm, which is fully consistent with the importance of CBs for snRNP formation in rapidly developing biological systems.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Molecular Biology of the Cell
ISSN
1059-1524
e-ISSN
—
Svazek periodika
22
Číslo periodika v rámci svazku
4
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000287305700008
EID výsledku v databázi Scopus
—