Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Histone deacetylase activity modulates alternative splicing

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F11%3A00364989" target="_blank" >RIV/68378050:_____/11:00364989 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0016727" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0016727</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0016727" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0016727</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Histone deacetylase activity modulates alternative splicing

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Increasing evidence suggests that splicing decisions are largely made when the nascent RNA is still associated with chromatin. Here we demonstrate that activity of histone deacetylases (HDACs) influences splice site selection. Using splicing-sensitive microarrays, we identified ca 700 genes whose splicing was altered after HDAC inhibition. We provided evidence that HDAC inhibition induced histone H4 acetylation and increased RNA Polymerase II (Pol II) processivity along an alternatively spliced element.In addition, HDAC inhibition reduced co-transcriptional association of the splicing regulator SRp40 with the target fibronectin exon. We further showed that the depletion of HDAC1 had similar effect on fibronectin alternative splicing as global HDAC inhibition. Importantly, this effect was reversed upon expression of mouse HDAC1 but not a catalytically inactive mutant. These results provide a molecular insight into a complex modulation of splicing by HDACs and chromatin modifications.

  • Název v anglickém jazyce

    Histone deacetylase activity modulates alternative splicing

  • Popis výsledku anglicky

    Increasing evidence suggests that splicing decisions are largely made when the nascent RNA is still associated with chromatin. Here we demonstrate that activity of histone deacetylases (HDACs) influences splice site selection. Using splicing-sensitive microarrays, we identified ca 700 genes whose splicing was altered after HDAC inhibition. We provided evidence that HDAC inhibition induced histone H4 acetylation and increased RNA Polymerase II (Pol II) processivity along an alternatively spliced element.In addition, HDAC inhibition reduced co-transcriptional association of the splicing regulator SRp40 with the target fibronectin exon. We further showed that the depletion of HDAC1 had similar effect on fibronectin alternative splicing as global HDAC inhibition. Importantly, this effect was reversed upon expression of mouse HDAC1 but not a catalytically inactive mutant. These results provide a molecular insight into a complex modulation of splicing by HDACs and chromatin modifications.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2011

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLoS ONE

  • ISSN

    1932-6203

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    6

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

    "e16727"

  • Kód UT WoS článku

    000287036200036

  • EID výsledku v databázi Scopus