Histone deacetylase activity modulates alternative splicing
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F11%3A00364989" target="_blank" >RIV/68378050:_____/11:00364989 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0016727" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0016727</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0016727" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0016727</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Histone deacetylase activity modulates alternative splicing
Popis výsledku v původním jazyce
Increasing evidence suggests that splicing decisions are largely made when the nascent RNA is still associated with chromatin. Here we demonstrate that activity of histone deacetylases (HDACs) influences splice site selection. Using splicing-sensitive microarrays, we identified ca 700 genes whose splicing was altered after HDAC inhibition. We provided evidence that HDAC inhibition induced histone H4 acetylation and increased RNA Polymerase II (Pol II) processivity along an alternatively spliced element.In addition, HDAC inhibition reduced co-transcriptional association of the splicing regulator SRp40 with the target fibronectin exon. We further showed that the depletion of HDAC1 had similar effect on fibronectin alternative splicing as global HDAC inhibition. Importantly, this effect was reversed upon expression of mouse HDAC1 but not a catalytically inactive mutant. These results provide a molecular insight into a complex modulation of splicing by HDACs and chromatin modifications.
Název v anglickém jazyce
Histone deacetylase activity modulates alternative splicing
Popis výsledku anglicky
Increasing evidence suggests that splicing decisions are largely made when the nascent RNA is still associated with chromatin. Here we demonstrate that activity of histone deacetylases (HDACs) influences splice site selection. Using splicing-sensitive microarrays, we identified ca 700 genes whose splicing was altered after HDAC inhibition. We provided evidence that HDAC inhibition induced histone H4 acetylation and increased RNA Polymerase II (Pol II) processivity along an alternatively spliced element.In addition, HDAC inhibition reduced co-transcriptional association of the splicing regulator SRp40 with the target fibronectin exon. We further showed that the depletion of HDAC1 had similar effect on fibronectin alternative splicing as global HDAC inhibition. Importantly, this effect was reversed upon expression of mouse HDAC1 but not a catalytically inactive mutant. These results provide a molecular insight into a complex modulation of splicing by HDACs and chromatin modifications.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
PLoS ONE
ISSN
1932-6203
e-ISSN
—
Svazek periodika
6
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
"e16727"
Kód UT WoS článku
000287036200036
EID výsledku v databázi Scopus
—