Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Endogenous lentivirus in Malayan colugo (Galeopterus variegatus), a close relative of primates

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F14%3A00441030" target="_blank" >RIV/68378050:_____/14:00441030 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1186/s12977-014-0084-x" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1186/s12977-014-0084-x</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1186/s12977-014-0084-x" target="_blank" >10.1186/s12977-014-0084-x</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Endogenous lentivirus in Malayan colugo (Galeopterus variegatus), a close relative of primates

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Background: A significant fraction of mammalian genomes is composed of endogenous retroviral (ERV) sequences that are formed by germline infiltration of various retroviruses. In contrast to other retroviral genera, lentiviruses only rarely form ERV copies. We performed a computational search aimed at identification of novel endogenous lentiviruses in vertebrate genomes.Findings: Using the in silico strategy, we have screened 104 publicly available vertebrate genomes for the presence of endogenous lentivirus sequences. In addition to the previously described cases, the search revealed the presence of endogenous lentivirus in the genome of Malayan colugo (Galeopterus variegatus). At least three complete copies of this virus, denoted ELVgv, were detectedin the colugo genome, and approximately one hundred solo LTR sequences. The assembled consensus sequence of ELVgv had typical lentivirus genome organization including three predicted accessory genes. Phylogenetic analysis placed this viru

  • Název v anglickém jazyce

    Endogenous lentivirus in Malayan colugo (Galeopterus variegatus), a close relative of primates

  • Popis výsledku anglicky

    Background: A significant fraction of mammalian genomes is composed of endogenous retroviral (ERV) sequences that are formed by germline infiltration of various retroviruses. In contrast to other retroviral genera, lentiviruses only rarely form ERV copies. We performed a computational search aimed at identification of novel endogenous lentiviruses in vertebrate genomes.Findings: Using the in silico strategy, we have screened 104 publicly available vertebrate genomes for the presence of endogenous lentivirus sequences. In addition to the previously described cases, the search revealed the presence of endogenous lentivirus in the genome of Malayan colugo (Galeopterus variegatus). At least three complete copies of this virus, denoted ELVgv, were detectedin the colugo genome, and approximately one hundred solo LTR sequences. The assembled consensus sequence of ELVgv had typical lentivirus genome organization including three predicted accessory genes. Phylogenetic analysis placed this viru

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LK11215" target="_blank" >LK11215: Regulace aktivních endogenních retrovirů v savčím genomu</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Retrovirology

  • ISSN

    1742-4690

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    11

  • Číslo periodika v rámci svazku

    84

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    6

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000344509200001

  • EID výsledku v databázi Scopus