RecQ-core of BLM unfolds telomeric G-quadruplex in the absence of ATP
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F14%3A00455781" target="_blank" >RIV/68378050:_____/14:00455781 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gku856" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/nar/gku856</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gku856" target="_blank" >10.1093/nar/gku856</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
RecQ-core of BLM unfolds telomeric G-quadruplex in the absence of ATP
Popis výsledku v původním jazyce
Various helicases and single-stranded DNA (ss-DNA) binding proteins are known to destabilize G-quadruplex (GQ) structures, which otherwise result in genomic instability. Bulk biochemical studies have shown that Bloom helicase (BLM) unfolds both intermolecular and intramolecular GQ in the presence of ATP. Using single molecule FRET, we show that binding of RecQ-core of BLM (will be referred to as BLM) to ssDNA in the vicinity of an intramolecular GQ leads to destabilization and unfolding of the GQ in theabsence of ATP. We show that the efficiency of BLM-mediated GQ unfolding correlates with the binding stability of BLM to ssDNA overhang, as modulated by the nucleotide state, ionic conditions, overhang length and overhang directionality. In particular,we observed enhanced GQ unfolding by BLM in the presence of non-hydrolysable ATP analogs, which has implications for the underlying mechanism. We also show that increasing GQ stability, via shorter loops or higher ionic strength, reduces
Název v anglickém jazyce
RecQ-core of BLM unfolds telomeric G-quadruplex in the absence of ATP
Popis výsledku anglicky
Various helicases and single-stranded DNA (ss-DNA) binding proteins are known to destabilize G-quadruplex (GQ) structures, which otherwise result in genomic instability. Bulk biochemical studies have shown that Bloom helicase (BLM) unfolds both intermolecular and intramolecular GQ in the presence of ATP. Using single molecule FRET, we show that binding of RecQ-core of BLM (will be referred to as BLM) to ssDNA in the vicinity of an intramolecular GQ leads to destabilization and unfolding of the GQ in theabsence of ATP. We show that the efficiency of BLM-mediated GQ unfolding correlates with the binding stability of BLM to ssDNA overhang, as modulated by the nucleotide state, ionic conditions, overhang length and overhang directionality. In particular,we observed enhanced GQ unfolding by BLM in the presence of non-hydrolysable ATP analogs, which has implications for the underlying mechanism. We also show that increasing GQ stability, via shorter loops or higher ionic strength, reduces
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA204%2F09%2F0565" target="_blank" >GA204/09/0565: Úloha RECQ5 DNA helikázy při udržování stability genomu</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Nucleic Acids Research
ISSN
0305-1048
e-ISSN
—
Svazek periodika
42
Číslo periodika v rámci svazku
18
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
18
Strana od-do
11528-11545
Kód UT WoS článku
000347687100029
EID výsledku v databázi Scopus
—