Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

RecQ-core of BLM unfolds telomeric G-quadruplex in the absence of ATP

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F14%3A00455781" target="_blank" >RIV/68378050:_____/14:00455781 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gku856" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/nar/gku856</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gku856" target="_blank" >10.1093/nar/gku856</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    RecQ-core of BLM unfolds telomeric G-quadruplex in the absence of ATP

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Various helicases and single-stranded DNA (ss-DNA) binding proteins are known to destabilize G-quadruplex (GQ) structures, which otherwise result in genomic instability. Bulk biochemical studies have shown that Bloom helicase (BLM) unfolds both intermolecular and intramolecular GQ in the presence of ATP. Using single molecule FRET, we show that binding of RecQ-core of BLM (will be referred to as BLM) to ssDNA in the vicinity of an intramolecular GQ leads to destabilization and unfolding of the GQ in theabsence of ATP. We show that the efficiency of BLM-mediated GQ unfolding correlates with the binding stability of BLM to ssDNA overhang, as modulated by the nucleotide state, ionic conditions, overhang length and overhang directionality. In particular,we observed enhanced GQ unfolding by BLM in the presence of non-hydrolysable ATP analogs, which has implications for the underlying mechanism. We also show that increasing GQ stability, via shorter loops or higher ionic strength, reduces

  • Název v anglickém jazyce

    RecQ-core of BLM unfolds telomeric G-quadruplex in the absence of ATP

  • Popis výsledku anglicky

    Various helicases and single-stranded DNA (ss-DNA) binding proteins are known to destabilize G-quadruplex (GQ) structures, which otherwise result in genomic instability. Bulk biochemical studies have shown that Bloom helicase (BLM) unfolds both intermolecular and intramolecular GQ in the presence of ATP. Using single molecule FRET, we show that binding of RecQ-core of BLM (will be referred to as BLM) to ssDNA in the vicinity of an intramolecular GQ leads to destabilization and unfolding of the GQ in theabsence of ATP. We show that the efficiency of BLM-mediated GQ unfolding correlates with the binding stability of BLM to ssDNA overhang, as modulated by the nucleotide state, ionic conditions, overhang length and overhang directionality. In particular,we observed enhanced GQ unfolding by BLM in the presence of non-hydrolysable ATP analogs, which has implications for the underlying mechanism. We also show that increasing GQ stability, via shorter loops or higher ionic strength, reduces

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA204%2F09%2F0565" target="_blank" >GA204/09/0565: Úloha RECQ5 DNA helikázy při udržování stability genomu</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nucleic Acids Research

  • ISSN

    0305-1048

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    42

  • Číslo periodika v rámci svazku

    18

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    18

  • Strana od-do

    11528-11545

  • Kód UT WoS článku

    000347687100029

  • EID výsledku v databázi Scopus