Cubozoan genome illuminates functional diversification of opsins and photoreceptor evolution

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F15%3A00455852" target="_blank" >RIV/68378050:_____/15:00455852 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1038/srep11885" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/srep11885</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1038/srep11885" target="_blank" >10.1038/srep11885</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Cubozoan genome illuminates functional diversification of opsins and photoreceptor evolution

Popis výsledku v původním jazyce

Animals sense light primarily by an opsin-based photopigment present in a photoreceptor cell. Cnidaria are arguably the most basal phylum containing a well-developed visual system. The evolutionary history of opsins in the animal kingdom has not yet beenresolved. Here, we study the evolution of animal opsins by genome-wide analysis of the cubozoan jellyfish Tripedalia cystophora, a cnidarian possessing complex lens-containing eyes and minor photoreceptors. A large number of opsin genes with distinct tissue-and stage-specific expression were identified. Our phylogenetic analysis unequivocally classifies cubozoan opsins as a sister group to c-opsins and documents lineage-specific expansion of the opsin gene repertoire in the cubozoan genome. Functionalanalyses provided evidence for the use of the Gs-cAMP signaling pathway in a small set of cubozoan opsins, indicating the possibility that the majority of other cubozoan opsins signal via distinct pathways. Additionally, these tests uncov

Název v anglickém jazyce

Cubozoan genome illuminates functional diversification of opsins and photoreceptor evolution

Popis výsledku anglicky

Animals sense light primarily by an opsin-based photopigment present in a photoreceptor cell. Cnidaria are arguably the most basal phylum containing a well-developed visual system. The evolutionary history of opsins in the animal kingdom has not yet beenresolved. Here, we study the evolution of animal opsins by genome-wide analysis of the cubozoan jellyfish Tripedalia cystophora, a cnidarian possessing complex lens-containing eyes and minor photoreceptors. A large number of opsin genes with distinct tissue-and stage-specific expression were identified. Our phylogenetic analysis unequivocally classifies cubozoan opsins as a sister group to c-opsins and documents lineage-specific expansion of the opsin gene repertoire in the cubozoan genome. Functionalanalyses provided evidence for the use of the Gs-cAMP signaling pathway in a small set of cubozoan opsins, indicating the possibility that the majority of other cubozoan opsins signal via distinct pathways. Additionally, these tests uncov

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Scientific Reports

ISSN

2045-2322

e-ISSN

—

Svazek periodika

5

Číslo periodika v rámci svazku

Jul 8

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

19

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000357577400002

EID výsledku v databázi Scopus

—