Knime4HTS

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F15%3A00502797" target="_blank" >RIV/68378050:_____/15:00502797 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.knime.com/" target="_blank" >https://www.knime.com/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Knime4HTS

Popis výsledku v původním jazyce

Knime4HTS je kombinace nových uzlů (nodes) a připravených postupů (workflows), která je vytvořena za účelem zpracování HTS dat prostřednictvím analytické platformy Knime. S použitím těchto nástrojů je možné zpracovávat surová data ve sloupcové i maticové formě. KNIME4HTS poskytuje funkcionalitu pro normalizaci dat, selekci hitů, zobrazení teplotních map HTS destiček a vytváření reportů. Připravené postupy jsou také schopny vizualizace rozsáhlé chemické knihovny ve formě 2D chemického prostoru na základě fyzikálně-chemických nebo strukturních vlastností látek.

Název v anglickém jazyce

Knime4HTS

Popis výsledku anglicky

Knime4HTS is a set of new nodes and prepared workflows designed for the processing of HTS data via the Knime Analytics Platform. Using these tools, raw plate data in a matrix or column coordinate format can be analyzed. KNIME4HTS provides functionality for raw data normalization, hit selection, the visualization of plate heatmaps and generation of screening reports. Prepared workflows are also able to visualize large chemical libraries by means of chemical space according to their physico-chemical properties and structural features.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

<a href="/cs/project/LO1220" target="_blank" >LO1220: CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura chemické biologie</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Software-2

Technické parametry

Knime4HTS je kombinace nových uzlů (nodes) a připravených postupů (workflows), která je vytvořena za účelem zpracování HTS dat prostřednictvím analytické platformy Knime. S použitím těchto nástrojů je možné zpracovávat surová data ve sloupcové i maticové formě. KNIME4HTS poskytuje funkcionalitu pro normalizaci dat, selekci hitů, zobrazení teplotních map HTS destiček a vytváření reportů. Připravené postupy jsou také schopny vizualizace rozsáhlé chemické knihovny ve formě 2D chemického prostoru na základě fyzikálně-chemických nebo strukturních vlastností látek. https://openscreen.cz/software/knime4hts/home/

Ekonomické parametry

Použitím těchto nástrojů je možné zpracovávat surová data ve sloupcové i maticové formě. Tyto funkcionality výrazně zjednodušší uživatelům analýzu HTS dat.

IČO vlastníka výsledku

68378050

Název vlastníka

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v.v