Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Unraveling the phospholipid identity of the gene expression compartments by single molecule localization microscopy

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F21%3A00555844" target="_blank" >RIV/68378050:_____/21:00555844 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68378050:_____/21:00555845

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Unraveling the phospholipid identity of the gene expression compartments by single molecule localization microscopy

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Current models of gene expression acknowledge protein clustering and formation of transcriptional condensates as a driving force of gene expression. These models are mostly based on single-molecule localization microscopy (SMLM) which provided an unprecedented insight into the sub-nuclear organization of proteins and nucleic acids. However, the roles of nuclear lipids in the establishment of the functional nuclear architecture, apart from the nuclear envelope, has been neglected. Nevertheless, accumulating evidence suggests the involvement of nuclear lipids and particularly of phosphatidylinositol phosphates (PIPs) in gene expression. We used quantitative SMLM for the evaluation of the nuclear PIP distribution while preserving the context of nuclear architecture. We showed phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PI(4,5)P2), phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate (PI(3,4)P2) and phosphatidylinositol 4-monophosphate (PI(4)P) within nuclear speckles and in the nucleoplasmic foci. Moreover, we found PI(4,5)P2 and PI(3,4)P2 in the close proximity with the subset of RNA polymerase II (RNAPII) foci either in the nucleoplasm or nuclear speckles. We continue to uncover the PIP fingerprints in the subsequent stages of RNAPII transcription. Our efforts aim at elucidating the roles of nuclear PIPs in the compartmentalization of gene expression.

  • Název v anglickém jazyce

    Unraveling the phospholipid identity of the gene expression compartments by single molecule localization microscopy

  • Popis výsledku anglicky

    Current models of gene expression acknowledge protein clustering and formation of transcriptional condensates as a driving force of gene expression. These models are mostly based on single-molecule localization microscopy (SMLM) which provided an unprecedented insight into the sub-nuclear organization of proteins and nucleic acids. However, the roles of nuclear lipids in the establishment of the functional nuclear architecture, apart from the nuclear envelope, has been neglected. Nevertheless, accumulating evidence suggests the involvement of nuclear lipids and particularly of phosphatidylinositol phosphates (PIPs) in gene expression. We used quantitative SMLM for the evaluation of the nuclear PIP distribution while preserving the context of nuclear architecture. We showed phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PI(4,5)P2), phosphatidylinositol 3,4-bisphosphate (PI(3,4)P2) and phosphatidylinositol 4-monophosphate (PI(4)P) within nuclear speckles and in the nucleoplasmic foci. Moreover, we found PI(4,5)P2 and PI(3,4)P2 in the close proximity with the subset of RNA polymerase II (RNAPII) foci either in the nucleoplasm or nuclear speckles. We continue to uncover the PIP fingerprints in the subsequent stages of RNAPII transcription. Our efforts aim at elucidating the roles of nuclear PIPs in the compartmentalization of gene expression.

Klasifikace

  • Druh

    O - Ostatní výsledky

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10601 - Cell biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů