Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Ig Enhancers Increase RNA Polymerase II Stalling at Somatic Hypermutation Target Sequences

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F22%3A00555983" target="_blank" >RIV/68378050:_____/22:00555983 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://journals.aai.org/jimmunol/article/208/1/143/234155/Ig-Enhancers-Increase-RNA-Polymerase-II-Stalling" target="_blank" >https://journals.aai.org/jimmunol/article/208/1/143/234155/Ig-Enhancers-Increase-RNA-Polymerase-II-Stalling</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.4049/jimmunol.2100923" target="_blank" >10.4049/jimmunol.2100923</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Ig Enhancers Increase RNA Polymerase II Stalling at Somatic Hypermutation Target Sequences

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Somatic hypermutation (SHM) drives the genetic diversity of Ig genes in activated B cells and supports the generation of Abs with increased affinity for Ag. SHM is targeted to Ig genes by their enhancers (diversification activators [DIVACs]), but how the enhancers mediate this activity is unknown. We show using chicken DT40 B cells that highly active DIVACs increase the phosphorylation of RNA polymerase II (Pol II) and Pol II occupancy in the mutating gene with little or no accompanying increase in elongation competent Pol II or production of full-length transcripts, indicating accumulation of stalled Pol II. DIVAC has similar effect also in human Ramos Burkitt lymphoma cells. The DIVAC-induced stalling is weakly associated with an increase in the detection of ssDNA bubbles in the mutating target gene. We did not find evidence for antisense transcription, or that DIVAC functions by altering levels of H3K27ac or the histone variant H3.3 in the mutating gene. These findings argue for a connection between Pol II stalling and cis acting targeting elements in the context of SHM and thus define a mechanistic basis for locus-specific targeting of SHM in the genome. Our results suggest that DIVAC elements render the target gene a suitable platform for AID-mediated mutation without a requirement for increasing transcriptional output.

  • Název v anglickém jazyce

    Ig Enhancers Increase RNA Polymerase II Stalling at Somatic Hypermutation Target Sequences

  • Popis výsledku anglicky

    Somatic hypermutation (SHM) drives the genetic diversity of Ig genes in activated B cells and supports the generation of Abs with increased affinity for Ag. SHM is targeted to Ig genes by their enhancers (diversification activators [DIVACs]), but how the enhancers mediate this activity is unknown. We show using chicken DT40 B cells that highly active DIVACs increase the phosphorylation of RNA polymerase II (Pol II) and Pol II occupancy in the mutating gene with little or no accompanying increase in elongation competent Pol II or production of full-length transcripts, indicating accumulation of stalled Pol II. DIVAC has similar effect also in human Ramos Burkitt lymphoma cells. The DIVAC-induced stalling is weakly associated with an increase in the detection of ssDNA bubbles in the mutating target gene. We did not find evidence for antisense transcription, or that DIVAC functions by altering levels of H3K27ac or the histone variant H3.3 in the mutating gene. These findings argue for a connection between Pol II stalling and cis acting targeting elements in the context of SHM and thus define a mechanistic basis for locus-specific targeting of SHM in the genome. Our results suggest that DIVAC elements render the target gene a suitable platform for AID-mediated mutation without a requirement for increasing transcriptional output.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30102 - Immunology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA15-24776S" target="_blank" >GA15-24776S: Chybné cílení somatických hypermutací a jeho vliv na nestabilitu genomu B lymfocytů</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2022

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Journal of Immunology

  • ISSN

    0022-1767

  • e-ISSN

    1550-6606

  • Svazek periodika

    208

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    12

  • Strana od-do

    143-154

  • Kód UT WoS článku

    000735220200015

  • EID výsledku v databázi Scopus