Benchmark theoretical and experimental study on 15N NMR Shifts of oxidatively damaged guanine
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378271%3A_____%2F16%3A00502367" target="_blank" >RIV/68378271:_____/16:00502367 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.5b11428" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.5b11428</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.5b11428" target="_blank" >10.1021/acs.jpcb.5b11428</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Benchmark theoretical and experimental study on 15N NMR Shifts of oxidatively damaged guanine
Popis výsledku v původním jazyce
The 15N NMR shifts of 9-ethyl-8-oxoguanine (OG) were calculated and measured in liquid DMSO and in crystal. The calculated change of N9 NMR shift owing to notable N9-pyramidalization of OG in one previously found polymorph was 20.53 ppm. We therefore assume that the pyramidal geometry of N9 nitrogen that could occur for damaged DNA within hOGG1 catalytic site might be detectable with 15N NMR spectroscopy. The calculation protocol can be used for accurate structural interpretation of 15N NMR shifts of oxidatively damaged guanine DNA residue.
Název v anglickém jazyce
Benchmark theoretical and experimental study on 15N NMR Shifts of oxidatively damaged guanine
Popis výsledku anglicky
The 15N NMR shifts of 9-ethyl-8-oxoguanine (OG) were calculated and measured in liquid DMSO and in crystal. The calculated change of N9 NMR shift owing to notable N9-pyramidalization of OG in one previously found polymorph was 20.53 ppm. We therefore assume that the pyramidal geometry of N9 nitrogen that could occur for damaged DNA within hOGG1 catalytic site might be detectable with 15N NMR spectroscopy. The calculation protocol can be used for accurate structural interpretation of 15N NMR shifts of oxidatively damaged guanine DNA residue.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10610 - Biophysics
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Physical Chemistry B
ISSN
1520-6106
e-ISSN
—
Svazek periodika
120
Číslo periodika v rámci svazku
5
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
915-925
Kód UT WoS článku
000370210600006
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-84958559485