Searching for Important Amino Acids in DNA-binding Proteins for Histogram Methods
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F11%3A00181845" target="_blank" >RIV/68407700:21230/11:00181845 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.cs.gsu.edu/isbra11/wp-content/uploads/2010/07/ISBRA2011ShortAbstracts.pdf" target="_blank" >http://www.cs.gsu.edu/isbra11/wp-content/uploads/2010/07/ISBRA2011ShortAbstracts.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Searching for Important Amino Acids in DNA-binding Proteins for Histogram Methods
Popis výsledku v původním jazyce
We develop a method capable to identify important amino acids for histogram-based methods predicting DNA-binding propensity. This method can be used both for prediction from sequence information Tube Histograms) and prediction from structural information(Ball Histograms). We validate our method in prediction experiments using only proteins' primary structure, achieving favourable accuracies. Moreover, the histogram-based methods equipped with this new searching method also provide interpretable features involving distributions of amino acids.
Název v anglickém jazyce
Searching for Important Amino Acids in DNA-binding Proteins for Histogram Methods
Popis výsledku anglicky
We develop a method capable to identify important amino acids for histogram-based methods predicting DNA-binding propensity. This method can be used both for prediction from sequence information Tube Histograms) and prediction from structural information(Ball Histograms). We validate our method in prediction experiments using only proteins' primary structure, achieving favourable accuracies. Moreover, the histogram-based methods equipped with this new searching method also provide interpretable features involving distributions of amino acids.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
JC - Počítačový hardware a software
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/ME10047" target="_blank" >ME10047: Prediktivní datové modelování pro efektivní genovou terapii a transplantaci kostní dřeně</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů