Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Comparative Validation of Computer Programs for Haplotype Frequency Estimation from Donor Registry Data

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F13%3A00206568" target="_blank" >RIV/68407700:21230/13:00206568 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tan.12160/pdf" target="_blank" >http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tan.12160/pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1111/tan.12160" target="_blank" >10.1111/tan.12160</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Comparative Validation of Computer Programs for Haplotype Frequency Estimation from Donor Registry Data

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Estimation of human leukocyte antigen (HLA) haplotype frequencies from unrelated stem cell donor registries presents a challenge because of large sample sizes and heterogeneity of HLA typing data. For the 14th International HLA and Immunogenetics Workshop, five bioinformatics groups initiated the `Registry Diversity Component? aiming to cross-validate and improve current haplotype estimation tools. Five datasets were derived from different donor registries and then used as input for five different computer programs for haplotype frequency estimation. Because of issues related to heterogeneity and complexity of HLA typing data identified in the initial phase, the same five implementations, and two new ones, were used on simulated datasets in a controlled experiment where the correct results were known a priori. These datasets contained various fractions of missing HLA-DR modeled after European haplotype frequencies. We measured the contribution of sampling fluctuation and estimation err

  • Název v anglickém jazyce

    Comparative Validation of Computer Programs for Haplotype Frequency Estimation from Donor Registry Data

  • Popis výsledku anglicky

    Estimation of human leukocyte antigen (HLA) haplotype frequencies from unrelated stem cell donor registries presents a challenge because of large sample sizes and heterogeneity of HLA typing data. For the 14th International HLA and Immunogenetics Workshop, five bioinformatics groups initiated the `Registry Diversity Component? aiming to cross-validate and improve current haplotype estimation tools. Five datasets were derived from different donor registries and then used as input for five different computer programs for haplotype frequency estimation. Because of issues related to heterogeneity and complexity of HLA typing data identified in the initial phase, the same five implementations, and two new ones, were used on simulated datasets in a controlled experiment where the correct results were known a priori. These datasets contained various fractions of missing HLA-DR modeled after European haplotype frequencies. We measured the contribution of sampling fluctuation and estimation err

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    JC - Počítačový hardware a software

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2013

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Tissue Antigens - Immune Response Genetics

  • ISSN

    0001-2815

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    82

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    93-105

  • Kód UT WoS článku

    000321697900002

  • EID výsledku v databázi Scopus