Optimalizace zpracování obtížných difrakčních dat proteinového krystalu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21340%2F13%3A00211930" target="_blank" >RIV/68407700:21340/13:00211930 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Optimalizace zpracování obtížných difrakčních dat proteinového krystalu

Popis výsledku v původním jazyce

Zpracování difrakčních dat proteinového krystalu není vždy snadné, obzvlášť když difrakční snímky obsahují rozštěpené reflexe. Právě takový soubor dat byl zpracován v programech HKL2000, Mosflm a XDS. V práci jsou porovnávány různé přístupy programů ke zpracování a jejich vliv na výslednou mapu elektronové hustoty. Difrakční data se podařilo zpracovat ve všech jmenovaných programech, ovšem s různou kvalitou. Výstupní data byla použita pro výpočet map elektronových hustot, avšak dále byla upřesňována pouze mapa zkonstruovaná na základě dat z programu XDS, která vykazovala nejlepší statistiky.

Název v anglickém jazyce

Optimalization of difficult diffraction data processing of protein crystal

Popis výsledku anglicky

Diffraction data processing of protein crystal is not easy all the time, especially when the diffraction images contain split reflections. Exactly such dataset was processed using programs HKL2000, MOSFLM and XDS. Different approaches of the programs tothe processing and their influence on final electron density map are compared in this work. The diffraction data were processed in all named programs, but with different quality. The output data were used for calculation of electron density maps, but only the map constructed based on data from the program XDS, which showed the best statistics, was further refined.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

BM - Fyzika pevných látek a magnetismus

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Třetí studentská vědecká konference fyziky pevných látek

ISBN

978-80-01-05344-7

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

70-75

Název nakladatele

ČVUT, Fakulta jaderná a fyzikálně inženýrská

Místo vydání

Praha

Místo konání akce

Dvorská bouda

Datum konání akce

28. 6. 2013

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—