Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Crystallographic fragment screening-based study of a novel FAD-dependent oxidoreductase from Chaetomium thermophillum

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21340%2F21%3A00351034" target="_blank" >RIV/68407700:21340/21:00351034 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1107/S2059798321003533" target="_blank" >https://doi.org/10.1107/S2059798321003533</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1107/S2059798321003533" target="_blank" >10.1107/S2059798321003533</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Crystallographic fragment screening-based study of a novel FAD-dependent oxidoreductase from Chaetomium thermophillum

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The FAD-dependent oxidoreductase from Chaetomium thermophilum (CtFDO) is a novel thermostable glycoprotein from the glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase superfamily. However, CtFDO shows no activity toward the typical substrates of the family and high-throughput screening with around 1000 compounds did not yield any strongly reacting substrate. Therefore, protein crystallography, including crystallographic fragment screening, with 42 fragments and 37 other compounds was used to describe the ligand-binding sites of CtFDO and to characterize the nature of its substrate. The structure of CtFDO reveals an unusually wide-open solvent-accessible active-site pocket with a unique His-Ser amino-acid pair putatively involved in enzyme catalysis. A series of six crystal structures of CtFDO complexes revealed five different subsites for the binding of aryl moieties inside the active-site pocket and conformational flexibility of the interacting amino acids when adapting to a particular ligand. The protein is capable of binding complex polyaromatic substrates of molecular weight greater than 500 Da.

  • Název v anglickém jazyce

    Crystallographic fragment screening-based study of a novel FAD-dependent oxidoreductase from Chaetomium thermophillum

  • Popis výsledku anglicky

    The FAD-dependent oxidoreductase from Chaetomium thermophilum (CtFDO) is a novel thermostable glycoprotein from the glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase superfamily. However, CtFDO shows no activity toward the typical substrates of the family and high-throughput screening with around 1000 compounds did not yield any strongly reacting substrate. Therefore, protein crystallography, including crystallographic fragment screening, with 42 fragments and 37 other compounds was used to describe the ligand-binding sites of CtFDO and to characterize the nature of its substrate. The structure of CtFDO reveals an unusually wide-open solvent-accessible active-site pocket with a unique His-Ser amino-acid pair putatively involved in enzyme catalysis. A series of six crystal structures of CtFDO complexes revealed five different subsites for the binding of aryl moieties inside the active-site pocket and conformational flexibility of the interacting amino acids when adapting to a particular ligand. The protein is capable of binding complex polyaromatic substrates of molecular weight greater than 500 Da.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10610 - Biophysics

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_019%2F0000778" target="_blank" >EF16_019/0000778: Centrum pokročilých aplikovaných přírodních věd</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Acta Crystallographica Section D: Structural Biology

  • ISSN

    2059-7983

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    77

  • Číslo periodika v rámci svazku

    6

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    21

  • Strana od-do

    755-775

  • Kód UT WoS článku

    000659143800004

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85107445206