Application of Morphology Filters to Compensation of Lateral Illumination Inhomogeneities in Confocal Microscopy Images

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21460%2F10%3A00168769" target="_blank" >RIV/68407700:21460/10:00168769 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/67985823:_____/10:00347023

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Application of Morphology Filters to Compensation of Lateral Illumination Inhomogeneities in Confocal Microscopy Images

Popis výsledku v původním jazyce

Due to multiple distortion effects, confocal laser scanning microscopy (CLSM) images of even homogeneous specimen regions suffer from irregular brightness variations. Grayscale map variations hamper image postprocessing e.g. in alignment of overlapping regions of two images, in 3D reconstruction etc., since most measures of similarity assume a spatially independent grayscale map. In this paper, a fast correction method based on estimating a spatially variable illumination gain, and multiplying acquiredCLSM images by the inverse of the estimated gain, is presented. The method does not require any special calibration (reference) images since the gain estimate is extracted from the CLSM image being corrected itself. The proposed approach exploits two types of morphological filters: the median filter and a morphological operator called the upper Lipschitz cover.

Název v anglickém jazyce

Application of Morphology Filters to Compensation of Lateral Illumination Inhomogeneities in Confocal Microscopy Images

Popis výsledku anglicky

Due to multiple distortion effects, confocal laser scanning microscopy (CLSM) images of even homogeneous specimen regions suffer from irregular brightness variations. Grayscale map variations hamper image postprocessing e.g. in alignment of overlapping regions of two images, in 3D reconstruction etc., since most measures of similarity assume a spatially independent grayscale map. In this paper, a fast correction method based on estimating a spatially variable illumination gain, and multiplying acquiredCLSM images by the inverse of the estimated gain, is presented. The method does not require any special calibration (reference) images since the gain estimate is extracted from the CLSM image being corrected itself. The proposed approach exploits two types of morphological filters: the median filter and a morphological operator called the upper Lipschitz cover.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

JC - Počítačový hardware a software

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Analysis of Biomedical Signals and Images, BIOSIGNAL 2010, Proceedings

ISBN

978-80-214-4106-4

ISSN

1211-412X

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

—

Název nakladatele

Brno University of Technology

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

27. 6. 2010

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—