Molekulární charakteristika izolátů Streptococcus pneumoniae zachycených při selhání vakcinace proti pneumokokovým infekcím u dětí pod 5 let věku v ČR 2012-2014

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F75010330%3A_____%2F18%3A00012256" target="_blank" >RIV/75010330:_____/18:00012256 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2018-3-26/molekularni-charakteristika-izolatu-streptococcus-pneumoniae-zachycenych-pri-selhani-vakcinace-proti-pneumokokovym-infekcim-u-deti-pod-5-let-veku-v-cr-2012-2014-106819" target="_blank" >https://www.prolekare.cz/casopisy/epidemiologie/2018-3-26/molekularni-charakteristika-izolatu-streptococcus-pneumoniae-zachycenych-pri-selhani-vakcinace-proti-pneumokokovym-infekcim-u-deti-pod-5-let-veku-v-cr-2012-2014-106819</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Molekulární charakteristika izolátů Streptococcus pneumoniae zachycených při selhání vakcinace proti pneumokokovým infekcím u dětí pod 5 let věku v ČR 2012-2014

Popis výsledku v původním jazyce

Cíl práce: Práce se zaměřila na molekulární charakteristiku izolátů Streptococcus pneumoniae v České republice od pacientů, kteří byli očkováni konjugovanou pneumokokovou vakcínou, a přesto v letech 2012-2014 onemocněli invazivním pneumokokovým onemocněním (IPO), způsobeným sérotypem S. pneumoniae obsaženým v aplikované vakcíně. Cílovou skupinou byly děti pod pět let věku. Materiál a metody: Kmeny S. pneumoniae jsou zasílány do Národní referenční laboratoře pro streptokokové nákazy (NRL) z celé České republiky. Selhání vakcinace proti pneumokokovým infekcím bylo v souladu s mezinárodní definicí. V NRL běžně probíhá identifikace a typizace izolátů klasickými i molekulárními metodami. K charakterizaci osmi izolátů od pacientů se selháním vakcinace byla použita i detailnější multilokusová sekvenační typizace (MLST). Výsledky: V letech 2012-2014 bylo v České republice identifikováno osm kmenů S. pneumoniae při selhání vakcinace u dětí pod pět let věku. Jednalo se o sérotypy 1 (n = 4), 14 (n = 2) a 3 (n = 2). U sérotypu 1 byl nalezen pouze jeden sekvenační typ ST306, typický sekvenační typ sérotypu 1. Stejně tak byl u sérotypu 14 zachycen pouze sekvenační typ ST124, který je v ČR často spojen se sérotypem 14, i když v jiných geografických lokalitách jsou častěji nalézány i jiné ST. Sérotyp 3 je velice heterogenní, což se projevuje i v nalézaných ST. Identifikovali jsme klonální komplex ST505 a ST124. ST124 je celosvětově první nález u S. pneumoniae sérotypu 3. Závěr: Jsou prezentovány výsledky pilotního projektu v České republice molekulární charakterizace kmenů S. pneumoniae zachycených při selhání vakcinace u dětí pod pět let věku. Získaná data vedou ke zkvalitnění surveillance invazivních pneumokokových onemocnění v České republice.

Název v anglickém jazyce

Molecular characterization of Streptococcus pneumoniae isolates recovered from cases of pneumococcal vaccine failure in children under five years of age in the Czech Republic in 2012-2014

Popis výsledku anglicky

Objective: Molecular characterization of Streptococcus pneumoniae isolates recovered in the Czech Republic from previously vaccinated patients diagnosed with invasive pneumococcal disease caused by vaccine serotypes in 2012-2014. The target group were children under five years of age. Material and methods: S. pneumoniae strains are referred to the National Reference Laboratory for Streptococcal Infections (NRL) from all over the Czech Republic. Pneumococcal vaccine failure was identified based on the international definition. The NRL routinely performs identification and typing of isolates using both conventional and molecular methods. To characterize in more detail eight isolates from cases of pneumococcal vaccine failure, multilocus sequence typing (MLST) was used. Results: In 2012-2014, eight S. pneumoniae strains were recovered from children under five years of age diagnosed with vaccine failure. The strains were assigned to serotypes 1 (n = 4), 14 (n = 2), and 3 (n = 2). Serotype 1 isolates were of one sequence type, ST306, which is typical for serotype 1. Similarly, serotype 14 was exclusively of ST124, which is often linked to serotype 14 in the Czech Republic, although in other geographical areas, other STs are often found. Serotype 3 is highly heterogeneous, which is also reflected in multiple STs found in it. We identified a clonal complex comprising ST505 and ST124. ST124 is for the first time reported in S. pneumoniae of serotype 3 in the world. Conclusion: Results are presented of a pilot project conducted in the Czech Republic and focused on molecular characterization of S. pneumoniae strains recovered from cases of pneumococcal vaccine failure in children under five years of age. The data obtained are helpful in improving the surveillance of IPD in the Czech Republic.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

30102 - Immunology

Projekt

<a href="/cs/project/NV17-29256A" target="_blank" >NV17-29256A: Molekulární surveillance invazivního pneumokokového onemocnění v České republice, hodnocení vakcinační strategie a doporučení k aktualizaci</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie

ISSN

1210-7913

e-ISSN

—

Svazek periodika

67

Číslo periodika v rámci svazku

3

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

99-103

Kód UT WoS článku

000455471600001

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85059502022