Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Strain "Acinetobacter mesopotamicus" GC2 does not represent a novel species, but belongs to the species Acinetobacter lwoffii as revealed by whole-genome sequence-based analysis

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F75010330%3A_____%2F21%3A00013480" target="_blank" >RIV/75010330:_____/21:00013480 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11130/21:10416972

  • Výsledek na webu

    <a href="https://link.springer.com/article/10.1007/s00284-020-02275-x" target="_blank" >https://link.springer.com/article/10.1007/s00284-020-02275-x</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00284-020-02275-x" target="_blank" >10.1007/s00284-020-02275-x</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Strain "Acinetobacter mesopotamicus" GC2 does not represent a novel species, but belongs to the species Acinetobacter lwoffii as revealed by whole-genome sequence-based analysis

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The formal scientific name "Acinetobacter mesopotamicus" has recently been proposed for bacterial strain GC2 isolated from soil (Curr Microbiol 77:3192-3200). However, the recalculation of the average nucleotide identity (ANI) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH) parameters revealed that their values for the genome sequences of GC2 and Acinetobacter lwoffii NCTC 5866(T) were as high as 95.7% and 66.1%, respectively. Moreover, the ANI and dDDH values for the genome of GC2 tested against those of 10 reference strains of A. lwoffii were 95.5-96.7% and 65.5-74.2%, respectively, and fall within the intraspecies range of these values known for A. lwoffii. These data indicate that strain GC2 belongs to A. lwoffii and contradicts the results of the authors of the proposal, who found the ANI and dDDH values for the GC2 and A. lwoffii DSM 2403(T) genomes to be 88.87% and 36.1%, respectively. The misclassification of strain GC2 is likely to result from the use of an incorrect reference genome sequence for in silico comparative analyses.

  • Název v anglickém jazyce

    Strain "Acinetobacter mesopotamicus" GC2 does not represent a novel species, but belongs to the species Acinetobacter lwoffii as revealed by whole-genome sequence-based analysis

  • Popis výsledku anglicky

    The formal scientific name "Acinetobacter mesopotamicus" has recently been proposed for bacterial strain GC2 isolated from soil (Curr Microbiol 77:3192-3200). However, the recalculation of the average nucleotide identity (ANI) and digital DNA-DNA hybridization (dDDH) parameters revealed that their values for the genome sequences of GC2 and Acinetobacter lwoffii NCTC 5866(T) were as high as 95.7% and 66.1%, respectively. Moreover, the ANI and dDDH values for the genome of GC2 tested against those of 10 reference strains of A. lwoffii were 95.5-96.7% and 65.5-74.2%, respectively, and fall within the intraspecies range of these values known for A. lwoffii. These data indicate that strain GC2 belongs to A. lwoffii and contradicts the results of the authors of the proposal, who found the ANI and dDDH values for the GC2 and A. lwoffii DSM 2403(T) genomes to be 88.87% and 36.1%, respectively. The misclassification of strain GC2 is likely to result from the use of an incorrect reference genome sequence for in silico comparative analyses.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30303 - Infectious Diseases

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Current Microbiology

  • ISSN

    0343-8651

  • e-ISSN

    1432-0991

  • Svazek periodika

    78

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    2

  • Strana od-do

    369-370

  • Kód UT WoS článku

    000585984000001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85094947274