Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F86652036%3A_____%2F21%3A00554216" target="_blank" >RIV/86652036:_____/21:00554216 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68407700:21340/21:00355939
Výsledek na webu
<a href="https://pairef.fjfi.cvut.cz/" target="_blank" >https://pairef.fjfi.cvut.cz/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
PAIREF
Popis výsledku v původním jazyce
PAIREF is a scientific program for macromolecular crystallography. It automatically estimates an optimal high-resolution cutoff, the important parameter of experimental diffraction data. The algorithm is based on the paired refinement protocol. Further details were published in the following manuscripts: M. Malý, K. Diederichs, J. Dohnálek, P. Kolenko: Paired refinement under the control of PAIREF (2020) IUCrJ 7, 681-692, M. Malý, K. Diederichs, J. Dohnálek, P. Kolenko: PAIREF: paired refinement also for Phenix users (2021) Acta Cryst. F77, 226-229.
Název v anglickém jazyce
PAIREF
Popis výsledku anglicky
PAIREF is a scientific program for macromolecular crystallography. It automatically estimates an optimal high-resolution cutoff, the important parameter of experimental diffraction data. The algorithm is based on the paired refinement protocol. Further details were published in the following manuscripts: M. Malý, K. Diederichs, J. Dohnálek, P. Kolenko: Paired refinement under the control of PAIREF (2020) IUCrJ 7, 681-692, M. Malý, K. Diederichs, J. Dohnálek, P. Kolenko: PAIREF: paired refinement also for Phenix users (2021) Acta Cryst. F77, 226-229.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2021
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
v1.2.8
Technické parametry
PAIREF is a Python-based program for the Computational Crystallography Toolbox available for Windows, GNU/Linux and MacOS. Graphical and command-line interfaces are provided. For structure model refinement, PAIREF supports REFMAC5 (part of the CCP4 Software Suite) and phenix.refine (part of the Phenix package). This work is co-developed with the Czech Technical University in Prague, Faculty of Nuclear Sciences and Physical Engineering, Břehová 7, Prague, IČ: 68407700
Ekonomické parametry
This project was funded by the MEYS CR (projects CAAS – CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000778, BIOCEV – CZ.1.05/1.1.00/02.0109, and ELIBIO – CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000447) from the ERDF fund, by the Czech science foundation (project 18-10687S), by the Czech Academy of Sciences (project 86652036), and by the GA CTU in Prague (SGS19/189/OHK4/3T/14). This work is co-developed with the Czech Technical University in Prague, Faculty of Nuclear Sciences and Physical Engineering, Břehová 7, Prague, IČ: 68407700
IČO vlastníka výsledku
86652036
Název vlastníka
Institute of Biotechnology of the Czech Academy of Sciences