Molekulární epidemiologie invazivního meningokokového onemocnění v České republice.

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023

Veřejná soutěž

Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)

Hlavní účastníci

Státní zdravotní ústav

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-34887A

Název projektu anglicky

Molecular epidemiology of invasive meningococcal disease in the Czech Republic.

Anotace anglicky

The objective of this project is to set up the molecular surveillance of invasive meningococcal disease in the Czech Republic to be able to distinguish between vaccine failure and non-coverage by vaccine and to update the vaccination strategy recommendations according to the molecular surveillance results. To achieve this objective, the following steps will be made: collection of N. meningitidis isolates from invasive meningococcal disease, molecular characterisation of all disease-associated N. meningitidis strains by classical nucleotide sequence-based typing methods and antigen gene sequencing, implementation of new sequencing methods, i.e. whole-genome sequencing, implementation of a new PCR method, i.e. RT-PCR for non-culture molecular characterisation of agents in culture-negative cases of invasive meningococcal disease, characterisation of selected disease-associated N. meningitidis strains by whole-genome sequencing, analysis of molecular characteristics of N. meningitidis isolates, update of vaccination strategy recommendations in accordance with the results obtained.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

CEP - hlavní obor

FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30302 - Epidemiology
30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu probíhalo v souladu s plánem projektu a dle předloženého harmonogramu. Všechny stanovené cíle byly v průběhu řešení projektu dosaženy. Byly zavedeny nové molekulární metody: sekvenace celého genomu (Whole Genome Sequencing, WGS) Neisseria meningitidis a bezkultivační rt-PCR detekce a typizace N. meningitidis přímo z klinického materiálu. Tyto nové molekulární metody byly implementovány do programu surveillance invazivního meningokokového onemocnění v České republice a jejich výsledky zpřesňují data molekulární surveillance tohoto onemocnění, včetně informací o pokrytí českých izolátů N. meningitidis meningokokovými vakcínami. Molekulární surveillance invazivního meningokokového onemocnění byla podnětem k předložení návrhu k aktualizaci doporučení pro očkování proti invazivním meningokokovým onemocněním České vakcinologické společnosti ČLS JEP. Data molekulární charakterizace N. meningitidis získaná při řešení projektu byla průběžně hlášena do mezinárodních databází.

Zahájení řešení

1. 5. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

28. 6. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-MZ0-NV-U/01:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2019

Celkové uznané náklady

6 650 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 329 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

419 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč