Molekulární surveillance invazivního pneumokokového onemocnění v České republice, hodnocení vakcinační strategie a doporučení k aktualizaci

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023

Veřejná soutěž

Zdravotnický AV 3 (SMZ0201701)

Hlavní účastníci

Státní zdravotní ústav se sídlem v Praze

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-29256A

Název projektu anglicky

Molecular surveillance of invasive pneumococcal disease in the Czech Republic, assessment of vaccination strategy and recommendation for update

Anotace anglicky

The aim is the development of molecular surveillance of invasive pneumococcal disease in the Czech Republic, the assessment of current vaccination strategy effectiveness and recommendations for strategy updating. The following steps will be used: collection of S. pneumoniae strains isolated from patients with invasive pneumococcal disease in the period from 2017-2020; implementation of molecular typing (mPCR, rt-PCR) of S. pneumoniae directly from clinical specimens of culture-negative patients; molecular characterization by MLST (Multi Locus Sequence Typing), MLVA (Multi Locus Variable Analysis), WGS (Whole Genome Sequencing) of selected S. pneumoniae strains isolated from patients with invasive pneumococcal disease in the period 2007-2020; analysis of molecular characteristics of S. pneumoniae strains isolated from patients with invasive pneumococcal disease in the periods before and after introduction of pneumococcal conjugated vaccine into the immunization programme for young children; assessment of current vaccination strategy effectiveness and recommendations for its updating.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

CEP - hlavní obor

FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

1. Odborným přínosem projektu je vyvinutí molekulární surveillance invazivního pneumokokového onemocnění v ČR, sběr a identifikace českých izolátů S.Pneumoniae izolovaných od pacientů v časovém období let 2017-2020, jejich zařazení do národních, ale i mezinárodních databází, nezbytných pro další spolupráci ve sledování epidemiologie na molekulární a populační úrovni. Za přínos projektu také považuji využití výsledků v mezinárodním projektu surveillance invazivních respiračních infekcí a sledování invazivních infekcí způsobených pneumokokem během pandemie covid-19, do kterého bylo zapojeno 26 zemí z 6 kontinentů. Přínosem projektu je také provedení molekulární identifikace a typizace pneumokoka a výběr vhodné metody k vyšetřování klinických vzorků od pacientů z lokalit primárně sterilních, tedy z plné krve, séra, likvoru či tkáně. Projekt také umožnil získat přesná data o nejčastěji se vyskytujících sérotypech pneumokoka v ČR a jejich srovnání se zahraničními výsledky a distribucí sérot

Zahájení řešení

1. 4. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2021

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

19. 3. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-MZ0-NV-U

Datum dodání záznamu

24. 1. 2022

Celkové uznané náklady

6 516 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 195 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

321 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč