Environmental constraints on the evolution of plant genome architecture – regional and community scales perspectives
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-30313S
Alternative language
Project name in Czech
Vliv prostředí na evoluci genomové architektury rostlin v lokálním a regionálním měřítku
Annotation in Czech
V rámci projektu plánujeme naměřit jednoduchá genomická data (monoploidní velikost genomu, genomický GC obsah a ploidní stupeň) pro kompletní flóru cévnatých rostlin České republiky (> 2000 druhů). Tato data budou porovnána s dostupnými daty o vlastnostech rostlin a jejich prostředí pomocí fylogenetických komparativních metod. Oproti dosavadním studiím zde budeme v projektu definovat prostředí pomocí lokálních a regionálních společenstev druhů, což nám umožní v analýzách zohlednit efekt mezidruhových interakcí a efekt různých prostorových měřítek. Doufáme, že projekt výrazně zpřesní naše znalosti o vlivu prostředí na evoluci rostlinných genomů a naopak o vlivu vlastností genomů na ekologii druhů. Projekt by měl zejména (i) detekovat a odhadnout význam prostředí v evoluci rostlinných genomů a při selekci druhů s odlišnou genomovou strukturou v konkrétním prostředí, (ii) detekovat funkční znaky závislé na genomové architektuře, skrze které se tato selekce odehrává a (iii) nalézt faktory prostředí, které tuto selekci podmiňují.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project collected data on genomic characteristics (size, GC content) of over 1500 species of vascular plants, which represent nearly complete flora of the Czech Republic, and reconstructed their phylogeny in order to perform a rigorous analysis of the role of environment in plant genome evolution. The results have been published in three scientific papers and were presented at conferences.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Apr 23, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jun 12, 2019
Finance
Total approved costs
7,889 thou. CZK
Public financial support
7,889 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK