DNA structure in solution and at electrode surfaces: electrochemical methods as potent tools for the analysis of DNA structure and interactions.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-01625S
Alternative language
Project name in Czech
Struktura DNA v roztoku a na površích elektrod: elektrochemické metody jako účinné nástroje analýzy struktury a interakcí DNA.
Annotation in Czech
Předchozí výzkum prokázal vynikající vlastnosti elektrochemických metod při výzkumu struktury a interakcí DNA, zejména při studiu strukturních změn dvoušroubovicové DNA, poškození a hybridizace DNA. Tento projekt je zaměřen na rozšíření těchto poznatků na alternativní struktury DNA, jako jsou nekanonické DNA duplexy nebo guaninové a cytosinové kvadruplexy. Dříve popsané strukturní přechody specifických nukleotidových sekvencí (včetně sekvencí přirozených, např. telomerových) budou využity při hledání vztahu mezi tvorbou daných struktur a jejich chování na površích elektrod, jejich stabilitou při vystavení elektrickému poli a přístupností specifických zbytků nukleobází pro redukční a oxidační procesy. Bude zkoumán vliv záměn nukleobází, chemické modifikace a interakce s ligandy vázajícími se na specifické struktury. Na základě výsledků tohoto výzkumu budou navrženy nové elektroanalytické techniky pro studium struktury DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CG - Electrochemistry
CEP - secondary branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10406 - Analytical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Most of the aims in the project proposal were achieved. New information were obtained on the behaviour of homonucleotide blocks at the negatively charged electrode surface including adsorption/desorption phenomena and the reducibility of cytosine in homonucleotide blocks at high pH. This extends the knowledge about behaviour of different nucleic acid sequences at the electrically charged surfaces.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Nov 29, 2019
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 26, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP20-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2020
Finance
Total approved costs
4,476 thou. CZK
Public financial support
4,281 thou. CZK
Other public sources
195 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK