Mechanisms of transcriptional pulsing
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-12611S
Alternative language
Project name in Czech
Mechanismy transkripčního pulzování
Annotation in Czech
Díky zobrazení genové exprese v živých buňkách bylo zjištěno, že období vysoké transkripční aktivity jsou často střídána dlouhými obdobími bez transkripce. Tento fenomén označovaný jako transkripční pulzování je momentálně předmětem značného zájmu v oboru. Molekulární mechanismy zodpovědné za to, že se genová aktivita objevuje v pulzech, zůstávají zatím neznámé. V tomto projektu navrhujeme studium vlivu cis regulačních sekvencí na dynamiku transkripce v živých savčích buňkách. Vytvoříme buněčnou linii exprimující transgen, jehož transkripty bude možné detekovat pomocí reportérového systému PP7-GFP. Za účelem získání jednotlivých klonů lišících se pouze v sekvenci enhanceru provedeme výměny enhancerových kazet pomocí rekombinace. Na základě kvantitativní obrazové analýzy získaných mikroskopických dat identifikujeme sekvence regulující parametry pulsování. Tyto sekvence budou dále validovány za použití umlčení exprese faktorů, které se na ně vážou. Očekáváme, že výsledky tohoto projektu přinesou znalosti o nových aspektech genové regulace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The project provided insight into the stochastic process of gene regulation (pulsation of transcription) at the level of individual cells during the cell cycle. The output is two publications in journals with IF. Grant and financial rules have been respected.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2017
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
3,289 thou. CZK
Public financial support
3,289 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK