Molecular characterization of retinal and cerebellar defects caused by mutations in splicing factor Prpf8
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-04099S
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární charakterizace retinálních a cerebelárních defektů způsobených mutacemi sestřihového faktoru Prpf8
Annotation in Czech
Mutace v sestřihových faktorech jsou spojeny s různými dědičnými syndromy včetně retinitis pigmentosy (RP), neurodegenerace a kranio-faciálních malformací. Navzdory intenzivnímu výzkumu zůstávají molekulární mechanismy způsobující tkáňově-specifickou citlivost na tyto mutace neznámé. V tomto projektu budeme studovat myši exprimující patologické varianty sestřihového faktoru Prpf8, které odpovídají lidským mutacím způsobujícím RP. Naše pilotní experimenty odhalily u těchto myší defekty sítnice a degeneraci mozečku. Plánujeme zkombinovat analýzu transkriptomu s iCLIPem, abychom identifikovali defekty v RNA sestřihu indukované mutantními Prpf8. Poté použijeme imunohistochemii a světelnou/elektronovou mikroskopii k analýze primárních řasinek v oční sítnici a vyvíjejícím se mozečku. Otestujeme hypotézu, že změny ve struktuře řasinek způsobené chybným RNA sestřihem jsou společnou příčinou pozorovaných fenotypů. Nakonec budeme sledovat expresi sestřihových faktorů v cílových tkáních a zkoumat, zda pozorované tkáňově specifické fenotypy korelují s lokálním množstvím sestřihových faktorů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 12, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
10,124 thou. CZK
Public financial support
10,124 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK