Relevance of duplicated promoter sequences for the function of plant 35S rDNA intergenic spacers.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
SGA0202000001
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-28029S
Alternative language
Project name in Czech
Význam zdvojených promotorových sekvencí pro funkci rostlinných mezigenových mezerníků u 35S rDNA
Annotation in Czech
Duplikace promotorových sekvencí pro RNA Polymerázu I, označované jako mezerníkové promotory (SP), se vyskytují v mezigenových mezernících (IGS) pro 35S rDNA jak u živočichů, tak u rostlin. Přes jejich rozšíření však zůstává jejich funkce v transkripci rDNA v podstatě neznámá. Ukázali jsme, že příbuzné rostlinné druhy Tragopogon dubius a T. porrifolius se významně liší v repetitivním uspořádání IGS hlavně v důsledku odlišného počtu SP, jež jsou roztroušeny podél celé délky IGS. Za účelem pochopení významu SP u rostlin, využijeme tento jedinečný rostlinný systém pro studium konformace DNA, vazebných afinit k proteinům, struktury chromatinu a transkripční aktivity jednotlivých vysoce homologních promotorových duplikátů, jež se však nacházejí ve variabilním repetitivním okolí. Důraz bude kladen na charakterizaci a srovnání těch duplikací, jež jsou spojeny s produkcí primárních nebo mezerníkových transkriptů. Očekáváme, že výsledky pomohou lépe pochopit molekulární základ epigenetických jevů, spojených s funkcí rDNA, jako je jadérková dominance u mezidruhových hybridů a allopolyploidů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EF - Botany
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 8, 2022
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP23-GA0-GA-R
Data delivery date
Jun 26, 2023
Finance
Total approved costs
6,273 thou. CZK
Public financial support
6,273 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK